RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 ASGR2P07307 311 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 ALDH4A1P30038 563 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 PTGER1P34995 402 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 PRKAG1P54619 331 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 ACAD8Q9UKU7 415 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 M0R3G1 203 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 CD36P16671 472 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 SEC23BQ15437 767 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF750Q32MQ0 723 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM236Q5W0B7 351 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 PAQR7Q86WK9 346 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 LACC1Q8IV20 430 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 KCNK12Q9HB15 430 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 PALMDQ9NP74 551 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 CD93Q9NPY3 652 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 KLF15Q9UIH9 416 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 CES1P1Q9UKY3 287 aa22.62■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 MGAT4BQ9UQ53 548 aa22.62■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.61■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.61■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.61■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 NLGN4XQ8N0W4 816 aa22.61■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 UCK2Q9BZX2 261 aa22.61■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 BCL2L10Q9HD36 194 aa22.61■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 C16orf87Q6PH81 154 aa22.6■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM107Q6UX40 140 aa22.6■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 STX19Q8N4C7 294 aa22.6■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 SLC38A4Q969I6 547 aa22.6■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 GAL3ST3Q96A11 431 aa22.6■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.6■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 WFDC6Q9BQY6 131 aa22.6■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 YIPF4Q9BSR8 244 aa22.6■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.6■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 COMTD1Q86VU5 262 aa22.6■■□□□ 1.21
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TRIM54-201ENST00000296098 M0R3H8 397 aa22.59■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 PROM1O43490 865 aa22.59■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 APBB3O95704 486 aa22.59■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 CNR2P34972 360 aa22.59■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 OPRL1P41146 370 aa22.59■■□□□ 1.21
TRIM54-201ENST00000296098 NCS1P62166 190 aa22.59■■□□□ 1.21
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