RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52A4PA6NMU1 304 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 C8GP07360 202 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 RPIAP49247 311 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf28Q4W4Y0 310 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD46Q86W74 232 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX29P2Q8IUI4 249 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8J2Q8NGG1 315 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PANX1Q96RD7 426 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SACM1LQ9NTJ5 587 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRC5BQ9NZH0 403 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEB17A8MXT2 336 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1DO15297 605 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ASNA1O43681 348 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 LCKP06239 509 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 AMD1P17707 334 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 TPTEP56180 551 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP206Q8IYR0 622 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 APH1BQ8WW43 257 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PROX1Q92786 737 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CRELD1Q96HD1 420 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ADPRHL2Q9NX46 363 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL15Q9NXU5 204 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 MKLN1Q9UL63 735 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF232Q9UNY5 417 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX16Q9Y5Y5 336 aa24.94■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 A8MVJ9 347 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 hCG_2039718K7EN88 272 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 EPORP19235 508 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 GGT2P36268 569 aa24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 DEFA3P59666 94 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC80Q76M96 950 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCB10Q9NRK6 738 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 PDZK1P1A8MUH7 402 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SNPHO15079 494 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 DKK1O94907 266 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 MED26O95402 600 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 F3P13726 295 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 ETV6P41212 452 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 TIGD6Q17RP2 521 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SLX4IPQ5VYV7 408 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 METRNLQ641Q3 311 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4F3Q6IEY1 312 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 DEPDC4Q8N2C3 294 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CHTF18Q8WVB6 975 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRIT1Q9P2V4 623 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL3Q9UH77 587 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCA1A8K7I4 914 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A5O15375 505 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 PREPP48147 710 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 POC5Q8NA72 575 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 RASSF1Q9NS23 344 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 NPAP1Q9NZP6 1156 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 UGDHO60701 494 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2ADP20671 130 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPAP38571 399 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SP140Q13342 867 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 LAPTM4AQ15012 233 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC22Q8N4W6 341 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 COL21A1Q96P44 957 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2AJQ99878 128 aa24.91■■□□□ 1.58
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