RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Derl2Q8BNI4 239 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plekhs1Q8BW88 474 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptges2Q8BWM0 384 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tctn1Q8BZ64 593 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MetrnQ8C1Q4 291 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pqlc3Q8C6U2 202 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Agfg1Q8K2K6 561 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc22a22Q8R0S9 554 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eml3Q8VC03 897 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr77Q8VEY9 312 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1020Q8VFK7 317 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1346Q8VGH6 313 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr679Q8VGV0 315 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vsx1Q91V10 363 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkd1Q99MH6 471 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exosc1Q9DAA6 195 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nacc2Q9DCM7 586 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PolmQ9JIW4 496 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Upk3aQ9JKX8 287 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oaz3Q9R109 243 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pld1Q9Z280 1074 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mfsd13bA0A1L1SUA2 455 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r58G3X9U3 310 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20695H3BLK7 282 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd83O88324 196 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 F2rl3O88634 396 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csf2P01587 141 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sbk2P0C5K1 362 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxd8P23463 289 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AcadmP45952 421 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ArntP53762 791 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd244Q07763 397 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad51Q08297 339 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt2b36Q3UEP4 530 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5460Q3UQ97 254 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxr1Q3UTB7 268 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp974Q3UVF6 752 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata13Q5DU57 656 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Armc5Q5EBP3 926 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Crb2Q80YA8 1282 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Npas4Q8BGD7 802 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf786Q8BV42 777 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lcmt2Q8BYR1 686 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Yod1Q8CB27 343 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Teddm1bQ8CC62 306 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ffar2Q8VCK6 330 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1276Q8VF40 312 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr666Q8VH00 318 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uck2Q99PM9 261 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lgals2Q9CQW5 130 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm16286Q9CQX6 220 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf181Q9CY62 165 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hhipl2Q9D2G9 717 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TheglQ9DA15 459 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ift46Q9DB07 301 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr706Q9EPF8 316 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Jph1Q9ET80 660 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ntn4Q9JI33 628 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tsga8Q9JJL0 238 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxe3Q9QY14 288 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1508Q9R0K4 310 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sema4gQ9WUH7 837 aa6.29□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup18A2BIM8 181 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf382B2RXC5 579 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp607bG3X9H3 648 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6401L7N2C0 213 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FhitO89106 150 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mup11P04938 181 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppm1aP49443 382 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GlaP51569 419 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OcmP51879 109 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adamts8P57110 905 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc16a3P57787 470 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbpl1P62340 186 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmprss11cQ1JRP2 431 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myl12bQ3THE2 172 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctu2Q3U308 514 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21320Q4FZE8 181 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hepacam2Q4VAH7 463 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11992Q5SS90 291 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sgk494Q5SYL1 278 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Amer3Q6NS69 780 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas2r38Q7TQA6 331 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cadm2Q8BLQ9 435 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NarsQ8BP47 559 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Efemp1Q8BPB5 493 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IlvblQ8BU33 632 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr26Q8BZA7 337 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sertm1Q8CD78 107 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glis1Q8K1M4 789 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp7Q91Z46 422 aa6.28□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.9 ms