Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SUA2

Mfsd13b, Major facilitator superfamily domain-containing 13B, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Mfsd13bA0A1L1SUA2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mfsd13bA0A1L1SUA2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mfsd13bA0A1L1SUA2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mfsd13bA0A1L1SUA2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mfsd13bA0A1L1SUA2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mfsd13bA0A1L1SUA2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mfsd13bA0A1L1SUA2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms