RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641558.1

MFSD8-238, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 526 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-238	ENST00000641558	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		6.39	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		6.39	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	6.38	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		6.38	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	NLRP8	Q86W28	1048 aa		6.38	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		6.37	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	ATP2B4	P23634	1241 aa		6.37	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	RETREG2	Q8NC44	543 aa		6.37	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	RTN1	Q16799	776 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	SUSD3	Q96L08	255 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	STRN4	Q9NRL3	753 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	KLK14	Q9P0G3	267 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	BCS1L	Q9Y276	419 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	CTBS	Q01459	385 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	TNP2	Q05952	138 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	GRIN2C	Q14957	1233 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	C2CD2L	O14523	706 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	EFS	O43281	561 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	ADAMTS2	O95450	1211 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	CD33	P20138	364 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	MX2	P20592	715 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	FGFR3	P22607	806 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	COX20	Q5RI15	118 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	WHAMM	Q8TF30	809 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	MYO19	Q96H55	970 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	MBIP	Q9NS73	344 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	SEPT3	Q9UH03	358 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MFSD8-238	ENST00000641558	IGF1R	P08069	1367 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	SSFA2	P28290	1259 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	TYRO3	Q06418	890 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	FAM26D	Q5JW98	314 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	PHF24	Q9UPV7	400 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	SLURP2	P0DP57	97 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	CEP63	Q96MT8	703 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	UST	Q9Y2C2	406 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	TNFRSF10B	O14763	440 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	C16orf46	Q6P387	395 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	COL26A1	Q96A83	441 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	BRD7	Q9NPI1	651 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	ACD	Q96AP0	544 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	BMP4	P12644	408 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	IDH3A	P50213	366 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	IER5	Q5VY09	327 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	IFT43	Q96FT9	208 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	SLC30A3	Q99726	388 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	MARK1	Q9P0L2	795 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	MICAL2	O94851	1124 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	INPP5B	P32019	993 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	MTMR3	Q13615	1198 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	HIF1A	Q16665	826 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	FAM182B	Q5T319	152 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	KLF15	Q9UIH9	416 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MFSD8-238	ENST00000641558	OPLAH	O14841	1288 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MFSD8-238	ENST00000641558	ZBTB39	O15060	712 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MFSD8-238	ENST00000641558	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MFSD8-238	ENST00000641558	MAP2K3	P46734	347 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MFSD8-238	ENST00000641558	KCNQ4	P56696	695 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MFSD8-238	ENST00000641558	LAMC2	Q13753	1193 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MFSD8-238	ENST00000641558	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MFSD8-238	ENST00000641558	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41

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