RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636753.1

RYR3-222, Transcript of ryanodine receptor 3, human

TSL 5

Gene RYR3, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RYR3-222	ENST00000636753	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753		A0A1W2PNR3	127 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	EFS	O43281	561 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	CFP	P27918	469 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	XAGE2	Q96GT9	111 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	FBXL18	Q96ME1	805 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RYR3-222	ENST00000636753	PAPLN	O95428	1278 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	ATP4A	P20648	1035 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	CTSW	P56202	376 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	RNF43	Q68DV7	783 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	C1QL4	Q86Z23	238 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	CCDC102A	Q96A19	550 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	NEUROD1	Q13562	356 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	COL19A1	Q14993	1142 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	P3H3	Q8IVL6	736 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	BIN1	O00499	593 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	LILRB3	O75022	631 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	SCTR	P47872	440 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	FAM84A	Q96KN4	292 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	SUV39H1	O43463	412 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	ALX3	O95076	343 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	PRNP	P04156	253 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	PLA2G4A	P47712	749 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	ECM1	Q16610	540 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	QPCT	Q16769	361 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	RNF20	Q5VTR2	975 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	MSL1	Q68DK7	614 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753		Q6ZS46	218 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	NUDT8	Q8WV74	236 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	AIDA	Q96BJ3	306 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	SLC30A3	Q99726	388 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753		F8W735	103 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	RAP1GAP	P47736	663 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RYR3-222	ENST00000636753	DLL1	O00548	723 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	MESP2	Q0VG99	397 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	GGN	Q86UU5	652 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	RELT	Q969Z4	430 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	INHBB	P09529	407 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	SPEM2	Q0P670	501 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	NR6A1	Q15406	480 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	MSMP	Q1L6U9	139 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	MYRFL	Q96LU7	910 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	PIM2	Q9P1W9	311 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	HMX2	A2RU54	273 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	GLB1	P16278	677 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	PNMA1	Q8ND90	353 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RYR3-222	ENST00000636753	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		2.88	□□□□□ -1.95

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