RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616237.1

LHX1-202, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LHX1, Length 1,364 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-202ENST00000616237 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 SETDB2Q96T68 719 aa22.19■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 RGL2O15211 777 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 WWC1Q8IX03 1113 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 CHD4Q14839 1912 aa22.18■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 GNAI1P63096 354 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.17■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 BCS1LQ9Y276 419 aa22.16■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.15■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 HOXB7P09629 217 aa22.14■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 PIM2Q9P1W9 311 aa22.14■■□□□ 1.14
LHX1-202ENST00000616237 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.13■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.13■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 CNBD1Q8NA66 436 aa22.13■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.13■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.13■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 NUP98P52948 1817 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 COPS6Q7L5N1 327 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.12■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 ATP10DQ9P241 1426 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.11■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 FAM177BA6PVY3 158 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 TSPYL6Q8N831 410 aa22.1■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 H0YIN7 160 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 GPTP24298 496 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.09■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 IL16Q14005 1332 aa22.08■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LHX1-202ENST00000616237 PDE6BP35913 854 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 ST5P78524 1137 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.08■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 NPHP1O15259 732 aa22.07■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.07■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 SUSD4Q5VX71 490 aa22.06■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 WDR63Q8IWG1 891 aa22.06■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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LHX1-202ENST00000616237 ABCC12Q96J65 1359 aa22.05■■□□□ 1.12
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LHX1-202ENST00000616237 TTLL6Q8N841 843 aa22.04■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.04■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 ERFEQ4G0M1 354 aa22.03■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 HYPKQ9NX55 129 aa22.03■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.03■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 CCER2I3L3R5 266 aa22.02■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 NTSR2O95665 410 aa22.02■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 ADCY9O60503 1353 aa22.02■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LHX1-202ENST00000616237 TCIRG1Q13488 830 aa22.01■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 NYXQ9GZU5 481 aa22.01■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 STYK1Q6J9G0 422 aa22■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 PLBD2Q8NHP8 589 aa22■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 ZNF521Q96K83 1311 aa22■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 PARP10Q53GL7 1025 aa21.99■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 MASTLQ96GX5 879 aa21.99■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.99■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.99■■□□□ 1.11
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LHX1-202ENST00000616237 NLRP10Q86W26 655 aa21.99■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.98■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 SLX4Q8IY92 1834 aa21.97■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 NPR1P16066 1061 aa21.97■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 CRY2Q49AN0 593 aa21.97■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.97■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 CNKSR1Q969H4 720 aa21.97■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 ZNF428Q96B54 188 aa21.97■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.97■■□□□ 1.11
LHX1-202ENST00000616237 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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