RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610074.1

PCMTD2-210, Transcript of protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2, human

TSL 4

Gene PCMTD2, Length 541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCMTD2-210	ENST00000610074	APBA3	O96018	575 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCMTD2-210	ENST00000610074	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCMTD2-210	ENST00000610074	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCMTD2-210	ENST00000610074	MDFI	Q99750	246 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PCMTD2-210	ENST00000610074	DYRK3	O43781	588 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	VAC14	Q08AM6	782 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	TXLNA	P40222	546 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	SMARCA4	P51532	1647 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074		M0R082	166 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	ARTN	Q5T4W7	220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	SIN3B	O75182	1162 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-210	ENST00000610074	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	GRIK4	Q16099	956 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	ALB	P02768	609 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	SLC30A3	Q99726	388 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	NACC1	Q96RE7	527 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	BACH1	O14867	736 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	EML1	O00423	815 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	ABL2	P42684	1182 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	NBPF11	Q86T75	865 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	NID1	P14543	1247 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	NOS2	P35228	1153 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	ADH7	P40394	386 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	TEAD4	Q15561	434 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-210	ENST00000610074	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	SPEM2	Q0P670	501 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	LCE3B	Q5TA77	95 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	ZNF358	Q9NW07	568 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	WDR62	O43379	1518 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	GTF2I	P78347	998 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	PSME1	Q06323	249 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	EML3	Q32P44	896 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	NOD1	Q9Y239	953 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	C9orf172	C9J069	976 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	SELP	P16109	830 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	EPHA4	P54764	986 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	NEUROD1	Q13562	356 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	ADGRE1	Q14246	886 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	TNS4	Q8IZW8	715 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	SOX11	P35716	441 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	MBTPS1	Q14703	1052 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-210	ENST00000610074	SERTM1	A2A2V5	107 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074	LILRB5	O75023	590 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074	SKI	P12755	728 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074	LRP8	Q14114	963 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074	CEP63	Q96MT8	703 aa		9.95	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074	BRD7	Q9NPI1	651 aa		9.95	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074		A0A0A0MRY4	1105 aa		9.94	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074	ELN	P15502	786 aa		9.94	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		9.94	□□□□□ -0.82
PCMTD2-210	ENST00000610074	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		9.94	□□□□□ -0.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms