RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	SNRK	Q9NRH2	765 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	HOXB7	P09629	217 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	NUCB1	Q02818	461 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP85	Q6P2H3	762 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	GORAB	Q5T7V8	394 aa		12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	NCAPD2	Q15021	1401 aa		12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	USP16	Q9Y5T5	823 aa		12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	A1BG	P04217	495 aa		12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	COPS6	Q7L5N1	327 aa		12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	NEK4	P51957	841 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	STK3	Q13188	491 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOC5	O00471	708 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	RGS12	O14924	1447 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	CHGB	P05060	677 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.96	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	AACS	Q86V21	672 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	SNAP23	O00161	211 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	EP400	Q96L91	3159 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	SDS	P20132	328 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A087WZG4	1122 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	DDB1	Q16531	1140 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF214	Q8ND24	703 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	MCTP1	Q6DN14	999 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	PHF14	O94880	888 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	APP	P05067	770 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	ADCY9	O60503	1353 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	TIMM10	P62072	90 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	GRM8	O00222	908 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	IGSF3	O75054	1194 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CTCFL-222	ENST00000609232	COL18A1	P39060	1754 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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