RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGKV5-2P06315 115 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C5P01031 1676 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL27Q8NEV9 243 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP16Q9Y5T5 823 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MCM2P49736 904 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAK2O60296 914 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GCKRQ14397 625 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KAZALD1Q96I82 304 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL17RAQ96F46 866 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYD88Q99836 296 aa22.66■■□□□ 1.22
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.66■■□□□ 1.22
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERBB4Q15303 1308 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEK4P51957 841 aa22.64■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SGSM2O43147 1006 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL2RBP14784 551 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AACSQ86V21 672 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SSFA2P28290 1259 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSPA4P34932 840 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PALD1Q9ULE6 856 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SASH1O94885 1247 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EVA1CP58658 441 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL15A1P39059 1388 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAD50Q92878 1312 aa22.58■■□□□ 1.21
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIP1O00291 1037 aa22.55■■□□□ 1.2
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 GLI3P10071 1580 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A087WZG4 1122 aa22.54■■□□□ 1.2
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCA3Q99758 1704 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 FSD2A1L4K1 749 aa22.5■■□□□ 1.19
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.5■■□□□ 1.19
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CASP7P55210 303 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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