RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600277.5

SLC27A1-208, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC27A1, Length 1,423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-208ENST00000600277 FLIIQ13045 1269 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC27A1-208ENST00000600277 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC27A1-208ENST00000600277 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SLC27A1-208ENST00000600277 MTFR1LQ9H019 292 aa28.2■■■□□ 2.11
SLC27A1-208ENST00000600277 PTGER2P43116 358 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 KIF16BQ96L93 1317 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 PTPRCP08575 1304 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 GYS1P13807 737 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 MSL1Q68DK7 614 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 C4AP0C0L4 1744 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 RGL2O15211 777 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 CAMTA2O94983 1202 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC27A1-208ENST00000600277 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.14■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 POLD1P28340 1107 aa28.12■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 ADCY9O60503 1353 aa28.12■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 FKBP8Q14318 412 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 KSR2Q6VAB6 950 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 HLFQ16534 295 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 TRIM27P14373 513 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC27A1-208ENST00000600277 MMP10P09238 476 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 F6X3S4 739 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 SCN7AQ01118 1682 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 CACNA1FO60840 1977 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 NFIXQ14938 502 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 SETDB2Q96T68 719 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 TM4SF1P30408 202 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 BCORQ6W2J9 1755 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 ABCC4O15439 1325 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 PLIN1O60240 522 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 TCIRG1Q13488 830 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 TNNQ9UQP3 1299 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 ATP10DQ9P241 1426 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 SYT17Q9BSW7 474 aa28.01■■■□□ 2.08
SLC27A1-208ENST00000600277 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 BEND3Q5T5X7 828 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 IGKV5-2P06315 115 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 NUP98P52948 1817 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 GPTP24298 496 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 DDR1Q08345 913 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 LINS1Q8NG48 757 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 MYD88Q99836 296 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 NPHP1O15259 732 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 SERPINB2P05120 415 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 PDE3AQ14432 1141 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 MS4A1P11836 297 aa27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 RLBP1P12271 317 aa27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.96■■■□□ 2.07
SLC27A1-208ENST00000600277 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms