RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 ZMYM3Q14202 1370 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 ITGB2P05107 769 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 NPATQ14207 1427 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 GMCL1Q96IK5 515 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 NCOA1Q15788 1441 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 BCRP11274 1271 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 NBPF15Q8N660 670 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 DCAF5Q96JK2 942 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 NLRP3Q96P20 1036 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 MIA2Q96PC5 1412 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 CLN3Q13286 438 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 FBXO41Q8TF61 875 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 PTPRTO14522 1441 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 H7C1W4 665 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 THBS1P07996 1170 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 MX2P20592 715 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 GGT6Q6P531 493 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 CEP152O94986 1710 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 ABCC5O15440 1437 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 PZPP20742 1482 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 ABCC3O15438 1527 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 TRAK2O60296 914 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 GPR37L1O60883 481 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 TRIM52Q96A61 297 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 DEPDC5O75140 1603 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 MSTNO14793 375 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 RNF20Q5VTR2 975 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 PODNQ7Z5L7 613 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 SNRKQ9NRH2 765 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 PLA2R1Q13018 1463 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 KIF3BO15066 747 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 PROCP04070 461 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 NR1H3Q13133 447 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 GPAMQ9HCL2 828 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 F11P03951 625 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 DAPK1P53355 1430 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 OIP5O43482 229 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 ADAM23O75077 832 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 IL2RAP01589 272 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 CCDC125Q86Z20 511 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 PHKA2P46019 1235 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 WDR44Q5JSH3 913 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 CNKSR1Q969H4 720 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-212ENST00000597259 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms