RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594965.1

GTF2F1-204, Transcript of general transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF2F1, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1-204ENST00000594965 PDIA6Q15084 440 aa29.18■■■□□ 2.26
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GTF2F1-204ENST00000594965 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.18■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.18■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 CFAP44Q96MT7 982 aa29.18■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 MRS2Q9HD23 443 aa29.18■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.18■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 ZNF853P0CG23 659 aa29.16■■■□□ 2.26
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GTF2F1-204ENST00000594965 PROSER3Q2NL68 480 aa29.15■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.15■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.14■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.14■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 CNBD1Q8NA66 436 aa29.14■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.14■■■□□ 2.26
GTF2F1-204ENST00000594965 ADCY9O60503 1353 aa29.13■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 CACNA1SQ13698 1873 aa29.13■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 ANXA1P04083 346 aa29.13■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 MBIPQ9NS73 344 aa29.13■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 SBF1O95248 1867 aa29.12■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 NECTIN2Q92692 538 aa29.12■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.11■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.11■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.1■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 H0YIN7 160 aa29.1■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 PDE6BP35913 854 aa29.1■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 IFT57Q9NWB7 429 aa29.1■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 ATP10DQ9P241 1426 aa29.1■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.09■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.09■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 ST5P78524 1137 aa29.09■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.09■■■□□ 2.25
GTF2F1-204ENST00000594965 HOXB7P09629 217 aa29.07■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 GNAI1P63096 354 aa29.07■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 TTLL6Q8N841 843 aa29.07■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.07■■■□□ 2.24
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GTF2F1-204ENST00000594965 NPHP1O15259 732 aa29.06■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.06■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 SLX4Q8IY92 1834 aa29.06■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 FAM177BA6PVY3 158 aa29.05■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 CCDC27Q2M243 656 aa29.05■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.05■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.05■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.04■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 COPS6Q7L5N1 327 aa29.04■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.04■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.04■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 SRGNP10124 158 aa29.03■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.03■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.03■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.247e-7■■■□□ 17.3
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GTF2F1-204ENST00000594965 WWC1Q8IX03 1113 aa29.02■■■□□ 2.24
GTF2F1-204ENST00000594965 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.02■■■□□ 2.24
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GTF2F1-204ENST00000594965 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 SUSD4Q5VX71 490 aa29■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 ABCC12Q96J65 1359 aa29■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 STYK1Q6J9G0 422 aa28.99■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.99■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 MASTLQ96GX5 879 aa28.99■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.98■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 NYXQ9GZU5 481 aa28.98■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.97■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 RASSF7Q02833 373 aa28.96■■■□□ 2.23
GTF2F1-204ENST00000594965 ERFEQ4G0M1 354 aa28.96■■■□□ 2.23
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GTF2F1-204ENST00000594965 NTSR2O95665 410 aa28.95■■■□□ 2.22
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GTF2F1-204ENST00000594965 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 C21orf2O43822 256 aa28.93■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 NPR1P16066 1061 aa28.93■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 TSPYL6Q8N831 410 aa28.93■■■□□ 2.22
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GTF2F1-204ENST00000594965 LAMB2P55268 1798 aa28.93■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 NFKBIEO00221 500 aa28.92■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 PARP10Q53GL7 1025 aa28.92■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 HYPKQ9NX55 129 aa28.92■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 IL16Q14005 1332 aa28.92■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 TCIRG1Q13488 830 aa28.91■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.91■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.91■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
GTF2F1-204ENST00000594965 RNF181Q9P0P0 153 aa28.91■■■□□ 2.22
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