RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	SETDB2	Q96T68	719 aa		29.09	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	29.09	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
APBA3-208	ENST00000592826	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		29.07	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		29.06	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	SERPINB2	P05120	415 aa		29.06	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		29.05	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		29.05	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		29.05	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29.05	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	ADCY9	O60503	1353 aa		29.04	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		29.04	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	NECTIN2	Q92692	538 aa		29.04	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		29.04	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	HYPK	Q9NX55	129 aa		29.04	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	GOLGA2	Q08379	1002 aa		29.03	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		29.03	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF521	Q96K83	1311 aa		29.02	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		29.02	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	CEP350	Q5VT06	3117 aa		29.02	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		29.02	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		29.02	■■■□□ 2.24
APBA3-208	ENST00000592826	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		29.01	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		29	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	PROSER3	Q2NL68	480 aa		29	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	HLF	Q16534	295 aa		28.99	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.99	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.99	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.99	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.98	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.98	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	ANXA1	P04083	346 aa		28.97	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.97	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.97	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.96	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	TSPYL6	Q8N831	410 aa		28.96	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		28.96	■■■□□ 2.23
APBA3-208	ENST00000592826	NPHP1	O15259	732 aa		28.95	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	CNBD1	Q8NA66	436 aa		28.95	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.94	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	ST5	P78524	1137 aa		28.94	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.94	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	STK31	Q9BXU1	1019 aa		28.94	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.94	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826		E9PSI1	815 aa		28.93	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.93	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.93	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.93	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	PDE6B	P35913	854 aa		28.92	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.92	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.92	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826		A0A0G2JLW4	131 aa		28.91	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	DPEP1	P16444	411 aa		28.91	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	NUP98	P52948	1817 aa		28.91	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.9	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	VAMP4	O75379	141 aa		28.89	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.89	■■■□□ 2.22
APBA3-208	ENST00000592826	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826		H0YIN7	160 aa		28.88	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.88	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.88	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	KCNA3	P22001	575 aa		28.87	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	HSPA6	P17066	643 aa		28.86	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.86	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.86	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	GPT	P24298	496 aa		28.85	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.85	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		28.84	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		28.84	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	SLC4A2	P04920	1241 aa		28.83	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	CHRNA5	P30532	468 aa		28.83	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.83	■■■□□ 2.21
APBA3-208	ENST00000592826	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.82	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.81	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	KIF3C	O14782	793 aa		28.8	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.8	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	NTSR2	O95665	410 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.79	■■■□□ 2.2
APBA3-208	ENST00000592826	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2

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