RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591964.5

PQLC1-213, Transcript of PQ loop repeat containing 1, human

TSL 3

Gene PQLC1, Length 856 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC1-213	ENST00000591964	RUNDC1	Q96C34	613 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PQLC1-213	ENST00000591964	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	33.38	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	NEUROD2	Q15784	382 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	NGEF	Q8N5V2	710 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	RNF181	Q9P0P0	153 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	33.36	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	HLF	Q16534	295 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	MYL6B	P14649	208 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	NUP98	P52948	1817 aa		33.32	■■■□□ 2.93
PQLC1-213	ENST00000591964	RASSF7	Q02833	373 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	KIF3C	O14782	793 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	CACNA1S	Q13698	1873 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	ERBB4	Q15303	1308 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	SRGN	P10124	158 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	STYK1	Q6J9G0	422 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	FAM177B	A6PVY3	158 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	LMNB1	P20700	586 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	CNKSR1	Q969H4	720 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	MASTL	Q96GX5	879 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	SLX4	Q8IY92	1834 aa		33.26	■■■□□ 2.92
PQLC1-213	ENST00000591964	C21orf2	O43822	256 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	CHL1	O00533	1208 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	NFKBIE	O00221	500 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	PRELP	P51888	382 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	PDIA6	Q15084	440 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	NYX	Q9GZU5	481 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	NPR1	P16066	1061 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PQLC1-213	ENST00000591964	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	TOMM70	O94826	608 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	GPT	P24298	496 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	NECTIN2	Q92692	538 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	PROSER3	Q2NL68	480 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	SOGA3	Q5TF21	947 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	ANXA1	P04083	346 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	APAF1	O14727	1248 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	KRT24	Q2M2I5	525 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PQLC1-213	ENST00000591964	ABCC12	Q96J65	1359 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	HSPA6	P17066	643 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	ERFE	Q4G0M1	354 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	SUSD4	Q5VX71	490 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	CFAP44	Q96MT7	982 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	RRAGC	Q9HB90	399 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	CEP350	Q5VT06	3117 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	ALDH1B1	P30837	517 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	33.11	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	GLTPD2	A6NH11	291 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	COPS6	Q7L5N1	327 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	HOXB7	P09629	217 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	PARP10	Q53GL7	1025 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	CCDC93	Q567U6	631 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	CRY2	Q49AN0	593 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PQLC1-213	ENST00000591964	NTSR2	O95665	410 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PQLC1-213	ENST00000591964	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PQLC1-213	ENST00000591964	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PQLC1-213	ENST00000591964	MBIP	Q9NS73	344 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PQLC1-213	ENST00000591964	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PQLC1-213	ENST00000591964	CCDC184	Q52MB2	194 aa		33.06	■■■□□ 2.88

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