RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 LRRC37A3O60309 1634 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 GRM8O00222 908 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 AK2P54819 239 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 PTH1RQ03431 593 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 RAD50Q92878 1312 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 BRD1O95696 1058 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 MYD88Q99836 296 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 NFAT5O94916 1531 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 COPS6Q7L5N1 327 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 GPATCH3Q96I76 525 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 CUL4AQ13619 759 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 FAM227BQ96M60 508 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 HYPKQ9NX55 129 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 AOX1Q06278 1338 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF790Q6PG37 636 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 LINS1Q8NG48 757 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 CACNA1FO60840 1977 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 CLCN1P35523 988 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 ERBB3P21860 1342 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 ALDH1L1O75891 902 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 LARGE1O95461 756 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 KAZALD1Q96I82 304 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 SASH1O94885 1247 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF445P59923 1031 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 RUFY3Q7L099 469 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 MPNDQ8N594 471 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 USP16Q9Y5T5 823 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 ATF3P18847 181 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 FSD1Q9BTV5 496 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 IGKV5-2P06315 115 aa20.18■□□□□ 0.82
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CTDP1-207ENST00000591598 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 FIBPO43427 364 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 USP48Q86UV5 1035 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 PDIA6Q15084 440 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-207ENST00000591598 MBD3O95983 291 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 SYT1P21579 422 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 CHGBP05060 677 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 MTX1Q13505 466 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 EVI5LQ96CN4 794 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 PHKG2P15735 406 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 A0A0D9SFI3 127 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 STX6O43752 255 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 TTC14Q96N46 770 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 STK3Q13188 491 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-207ENST00000591598 FERMT3Q86UX7 667 aa20.12■□□□□ 0.81
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