RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 NFKBIEO00221 500 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-210ENST00000591412 RIPK4P57078 832 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-210ENST00000591412 ST5P78524 1137 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-210ENST00000591412 HLFQ16534 295 aa17.54■□□□□ 0.4
CTIF-210ENST00000591412 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CTIF-210ENST00000591412 SRGNP10124 158 aa17.53■□□□□ 0.4
CTIF-210ENST00000591412 HSPA6P17066 643 aa17.53■□□□□ 0.4
CTIF-210ENST00000591412 LMNB1P20700 586 aa17.53■□□□□ 0.4
CTIF-210ENST00000591412 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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CTIF-210ENST00000591412 TOMM70O94826 608 aa17.52■□□□□ 0.4
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CTIF-210ENST00000591412 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.4
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CTIF-210ENST00000591412 BABAM1Q9NWV8 329 aa17.5■□□□□ 0.39
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CTIF-210ENST00000591412 LMOD3Q0VAK6 560 aa17.49■□□□□ 0.39
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CTIF-210ENST00000591412 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
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CTIF-210ENST00000591412 CEP350Q5VT06 3117 aa17.47■□□□□ 0.39
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CTIF-210ENST00000591412 LTBP3Q9NS15 1303 aa17.47■□□□□ 0.39
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CTIF-210ENST00000591412 FAM177BA6PVY3 158 aa17.46■□□□□ 0.39
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CTIF-210ENST00000591412 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-210ENST00000591412 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-210ENST00000591412 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-210ENST00000591412 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa17.46■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa17.45■□□□□ 0.38
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CTIF-210ENST00000591412 ZBTB3Q9H5J0 574 aa17.44■□□□□ 0.38
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CTIF-210ENST00000591412 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
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CTIF-210ENST00000591412 NUTM1Q86Y26 1132 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 NYXQ9GZU5 481 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 NUP98P52948 1817 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 TIAM2Q8IVF5 1701 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 APLP1P51693 650 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 FSTL1Q12841 308 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 CRY2Q49AN0 593 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 ERFEQ4G0M1 354 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 SUSD4Q5VX71 490 aa17.42■□□□□ 0.38
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CTIF-210ENST00000591412 CCDC93Q567U6 631 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 POTECB2RU33 542 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 NTSR2O95665 410 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 ANXA1P04083 346 aa17.4■□□□□ 0.38
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CTIF-210ENST00000591412 ALDH1B1P30837 517 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 KRT24Q2M2I5 525 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 OLFM4Q6UX06 510 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 CACNA1SQ13698 1873 aa17.39■□□□□ 0.38
CTIF-210ENST00000591412 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 33.9
CTIF-210ENST00000591412 DPY19L2Q6NUT2 758 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 NECTIN2Q92692 538 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 WDR90Q96KV7 1748 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 SNED1Q8TER0 1413 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 PARP10Q53GL7 1025 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 COPS6Q7L5N1 327 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-210ENST00000591412 RTKN2Q8IZC4 609 aa17.37■□□□□ 0.37
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