RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 H0YIN7 160 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF853P0CG23 659 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 CHRNA5P30532 468 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 HLFQ16534 295 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 WWC1Q8IX03 1113 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.5■■□□□ 1.51
GIPC1-210ENST00000589497 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.5■■□□□ 1.51
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GIPC1-210ENST00000589497 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.48■■□□□ 1.51
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GIPC1-210ENST00000589497 PDIA6Q15084 440 aa24.47■■□□□ 1.51
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GIPC1-210ENST00000589497 COPS6Q7L5N1 327 aa24.46■■□□□ 1.51
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GIPC1-210ENST00000589497 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
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GIPC1-210ENST00000589497 TTLL6Q8N841 843 aa24.42■■□□□ 1.5
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GIPC1-210ENST00000589497 IL16Q14005 1332 aa24.41■■□□□ 1.5
GIPC1-210ENST00000589497 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.41■■□□□ 1.5
GIPC1-210ENST00000589497 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.41■■□□□ 1.5
GIPC1-210ENST00000589497 CHD4Q14839 1912 aa24.4■■□□□ 1.5
GIPC1-210ENST00000589497 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.4■■□□□ 1.5
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GIPC1-210ENST00000589497 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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GIPC1-210ENST00000589497 TSPYL6Q8N831 410 aa24.34■■□□□ 1.49
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GIPC1-210ENST00000589497 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.34■■□□□ 1.49
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GIPC1-210ENST00000589497 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
GIPC1-210ENST00000589497 NUP98P52948 1817 aa24.33■■□□□ 1.48
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GIPC1-210ENST00000589497 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 C21orf2O43822 256 aa24.29■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 ALDH1B1P30837 517 aa24.29■■□□□ 1.48
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GIPC1-210ENST00000589497 NLRP3Q96P20 1036 aa24.29■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 NTSR2O95665 410 aa24.28■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 NLRP10Q86W26 655 aa24.28■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GIPC1-210ENST00000589497 SOGA3Q5TF21 947 aa24.27■■□□□ 1.48
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