RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 NUP98P52948 1817 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 CCER2I3L3R5 266 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 C1QTNF8P60827 252 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 CACNA1SQ13698 1873 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF26B4DH59 902 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 CAMTA2O94983 1202 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF15Q8N660 670 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 RUNDC1Q96C34 613 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
EFTUD2-210ENST00000588340 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 RIPK4P57078 832 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 SETDB2Q96T68 719 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 H0YIN7 160 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 PITPNM1O00562 1244 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC27Q2M243 656 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 RGL2O15211 777 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 PDE6BP35913 854 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC146Q8IYE0 955 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC24Q8N4L8 307 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 TTLL6Q8N841 843 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 MRS2Q9HD23 443 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 SLX4Q8IY92 1834 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF853P0CG23 659 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 CNBD1Q8NA66 436 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF521Q96K83 1311 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF3CO14782 793 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 NPHP1O15259 732 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ST5P78524 1137 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 NEUROD2Q15784 382 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 HLFQ16534 295 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 NGEFQ8N5V2 710 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.973e-9■□□□□ 9
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF181Q9P0P0 153 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 CHL1O00533 1208 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 APAF1O14727 1248 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 SRGNP10124 158 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 MYL6BP14649 208 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 RASSF7Q02833 373 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 ERBB4Q15303 1308 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-210ENST00000588340 POTEIP0CG38 1075 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 PRELPP51888 382 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 STYK1Q6J9G0 422 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 CNKSR1Q969H4 720 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 MASTLQ96GX5 879 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.96□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM177BA6PVY3 158 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 NFKBIEO00221 500 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 C21orf2O43822 256 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 LMNB1P20700 586 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 PDIA6Q15084 440 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 IL16Q14005 1332 aa8.95□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 TOMM70O94826 608 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 NPR1P16066 1061 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms