RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 CCDC27Q2M243 656 aa15.08■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.08■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.08■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 ZNF853P0CG23 659 aa15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 CHRNA5P30532 468 aa15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 KRT24Q2M2I5 525 aa15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 CHD4Q14839 1912 aa15.07■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.06■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 H0YIN7 160 aa15.06■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 PDE6BP35913 854 aa15.06■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.06■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.06■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.06■□□□□ 0
GGA3-204ENST00000578208 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 HLFQ16534 295 aa15.05■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.05■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.05■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 WWC1Q8IX03 1113 aa15.05■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.05■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 ATP10DQ9P241 1426 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 IL16Q14005 1332 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 FAM177BA6PVY3 158 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 ANXA1P04083 346 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 KCNA3P22001 575 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 PDIA6Q15084 440 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 PROSER3Q2NL68 480 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 NYXQ9GZU5 481 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.03■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.03■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.02■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.02■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 COPS6Q7L5N1 327 aa15.02■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 TTLL6Q8N841 843 aa15.02■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 HYPKQ9NX55 129 aa15.02■□□□□ -0
GGA3-204ENST00000578208 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 GPTP24298 496 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 NUP98P52948 1817 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.01□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 PARP10Q53GL7 1025 aa15□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 CCDC30Q5VVM6 783 aa15□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 WDR63Q8IWG1 891 aa15□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.99□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.99□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 MASTLQ96GX5 879 aa14.99□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 CCER2I3L3R5 266 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 GOLGA2Q08379 1002 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 STYK1Q6J9G0 422 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 CNKSR1Q969H4 720 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 STK31Q9BXU1 1019 aa14.98□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 SRGNP10124 158 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 SUSD4Q5VX71 490 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.97□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.96□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 NPR1P16066 1061 aa14.96□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 TCIRG1Q13488 830 aa14.96□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ERFEQ4G0M1 354 aa14.96□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GGA3-204ENST00000578208 ABCC12Q96J65 1359 aa14.96□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.95□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 NTSR2O95665 410 aa14.95□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 SOGA3Q5TF21 947 aa14.95□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.95□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 TSPYL6Q8N831 410 aa14.95□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 UTRNP46939 3433 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 ALDH1B1P30837 517 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGA3-204ENST00000578208 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms