RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 PXDNLA1KZ92 1463 aa36.61■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 RGL2O15211 777 aa36.6■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 KIF6Q6ZMV9 814 aa36.6■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 TTLL7Q6ZT98 887 aa36.6■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 CARMIL3Q8ND23 1372 aa36.59■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 DPEP1P16444 411 aa36.59■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 PROSER3Q2NL68 480 aa36.59■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 ANXA1P04083 346 aa36.58■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 HLFQ16534 295 aa36.58■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa36.58■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
NOMO3-217ENST00000576589 ERVV-1B6SEH8 477 aa36.57■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 LRP10Q7Z4F1 713 aa36.57■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa36.57■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 CCER2I3L3R5 266 aa36.56■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 IL16Q14005 1332 aa36.55■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 BCORQ6W2J9 1755 aa36.54■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 KIF13BQ9NQT8 1826 aa36.54■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 ZBTB3Q9H5J0 574 aa36.53■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.53■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 NPHP1O15259 732 aa36.52■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 PRR5LQ6MZQ0 368 aa36.52■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 WDR63Q8IWG1 891 aa36.52■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 C8orf58Q8NAV2 365 aa36.52■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 KCNA3P22001 575 aa36.51■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 CHRNA5P30532 468 aa36.51■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 BCS1LQ9Y276 419 aa36.51■■■■□ 3.44
NOMO3-217ENST00000576589 COPS6Q7L5N1 327 aa36.5■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 CNBD1Q8NA66 436 aa36.5■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 NRXN2Q9P2S2 1712 aa36.49■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC24Q8N4L8 307 aa36.49■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 XAGE3Q8WTP9 111 aa36.49■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa36.48■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 PIM2Q9P1W9 311 aa36.47■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 ST5P78524 1137 aa36.46■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 BRIP1Q9BX63 1249 aa36.45■■■■□ 3.43
NOMO3-217ENST00000576589 FAM177BA6PVY3 158 aa36.44■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 TSPYL6Q8N831 410 aa36.44■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 TPTE2Q6XPS3 522 aa36.43■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 C2CD5Q86YS7 1000 aa36.43■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 HYPKQ9NX55 129 aa36.43■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 GPTP24298 496 aa36.42■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 PDE6BP35913 854 aa36.42■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa36.42■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 CEP350Q5VT06 3117 aa36.41■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 H0YIN7 160 aa36.41■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 CHMP4AQ9BY43 222 aa36.41■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 FANCIQ9NVI1 1328 aa36.4■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF34Q8IZ26 560 aa36.4■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC30Q5VVM6 783 aa36.39■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa36.39■■■■□ 3.42
NOMO3-217ENST00000576589 MIER1Q8N108 512 aa36.38■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 UBN2Q6ZU65 1347 aa36.37■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 KIF3CO14782 793 aa36.37■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 NYXQ9GZU5 481 aa36.37■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 HSPA6P17066 643 aa36.36■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa36.36■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 GOLGA2Q08379 1002 aa36.35■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 SUSD4Q5VX71 490 aa36.35■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa36.35■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 PLBD2Q8NHP8 589 aa36.34■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 MYH16Q9H6N6 1097 aa36.34■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 PARP10Q53GL7 1025 aa36.33■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 TTLL6Q8N841 843 aa36.33■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP36.33■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF521Q96K83 1311 aa36.33■■■■□ 3.41
NOMO3-217ENST00000576589 TCIRG1Q13488 830 aa36.32■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 NUTM1Q86Y26 1132 aa36.32■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa36.31■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 NUP98P52948 1817 aa36.29■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 ERFEQ4G0M1 354 aa36.29■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 STK31Q9BXU1 1019 aa36.29■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 NTSR2O95665 410 aa36.28■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 SRGNP10124 158 aa36.28■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa36.26■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 RIC3Q7Z5B4 369 aa36.26■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 NLRP10Q86W26 655 aa36.26■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 MASTLQ96GX5 879 aa36.26■■■■□ 3.4
NOMO3-217ENST00000576589 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms