RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570569.1

TMEM256-PLSCR3-201, Transcript of TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 3

Gene TMEM256-PLSCR3, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TTLL6Q8N841 843 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 BCORQ6W2J9 1755 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CHL1O00533 1208 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ERBB4Q15303 1308 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ADCY9O60503 1353 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 APAF1O14727 1248 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 HLFQ16534 295 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ANP32CO43423 234 aa22.22■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.22■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.21■■□□□ 1.15
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 FAM177BA6PVY3 158 aa22.2■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CCDC184Q52MB2 194 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CFAP44Q96MT7 982 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.19■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 C1QTNF8P60827 252 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PDIA6Q15084 440 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 STYK1Q6J9G0 422 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NECTIN2Q92692 538 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CNKSR1Q969H4 720 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SRGNP10124 158 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KRT24Q2M2I5 525 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MASTLQ96GX5 879 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NYXQ9GZU5 481 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 RNF181Q9P0P0 153 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ANXA1P04083 346 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PROSER3Q2NL68 480 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MRS2Q9HD23 443 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NUP98P52948 1817 aa22.15■■□□□ 1.14
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 HOXB7P09629 217 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 GPTP24298 496 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 GNAI1P63096 354 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MBIPQ9NS73 344 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 C21orf2O43822 256 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 IFT57Q9NWB7 429 aa22.13■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZNF853P0CG23 659 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NPR1P16066 1061 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 RASSF7Q02833 373 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 COPS6Q7L5N1 327 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 LMNB1P20700 586 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PARP10Q53GL7 1025 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SUSD4Q5VX71 490 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SBF1O95248 1867 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ERFEQ4G0M1 354 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SOGA3Q5TF21 947 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NFKBIEO00221 500 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ALDH1B1P30837 517 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SLX4Q8IY92 1834 aa22.07■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 HYPKQ9NX55 129 aa22.06■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ABCC12Q96J65 1359 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KIF3CO14782 793 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NTSR2O95665 410 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CCDC27Q2M243 656 aa22.05■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PRELPP51888 382 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TCIRG1Q13488 830 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CRY2Q49AN0 593 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.04■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CCDC93Q567U6 631 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms