RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569773.1

GDE1-204, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GDE1, Length 739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-204ENST00000569773 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.74□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 ERVK-9P63128 1117 aa8.73□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.73□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.73□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 ERBINQ96RT1 1412 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 SLIT1O75093 1534 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 LILRA1O75019 489 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 MYT1Q01538 1121 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 HPS1Q92902 700 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 ITPKCQ96DU7 683 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 SIRT1Q96EB6 747 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 PIK3C2BO00750 1634 aa8.72□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 DAPK1P53355 1430 aa8.71□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.71□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.71□□□□□ -1.01
GDE1-204ENST00000569773 SYNMO15061 1565 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 RASA1P20936 1047 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 GTF2IP78347 998 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 CLDN10P78369 228 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 TRIM50Q86XT4 487 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 OGFOD1Q8N543 542 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ARXQ96QS3 562 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 KIF15Q9NS87 1388 aa8.71□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.7□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 FAM187AA6NFU0 413 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 FAM196BA6NMK8 535 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L15C9J2P7 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L10C9JJH3 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L12C9JPN9 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L11C9JVI0 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L21D6R901 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L18D6R9N7 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L22D6RA61 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L19D6RCP7 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L20D6RJB6 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ATG7O95352 703 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 TIMP2P16035 220 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ATP1A2P50993 1020 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 PSME1Q06323 249 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 USP17L24Q0WX57 530 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 CBLBQ13191 982 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ZNF787Q6DD87 383 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 HOMEZQ8IX15 550 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ADGRL2O95490 1459 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.69□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 LCE2BO14633 110 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 PTK7Q13308 1070 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 RETREG2Q8NC44 543 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 TRIM52Q96A61 297 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.68□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.67□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 TET3O43151 1660 aa8.66□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 NOS1P29475 1434 aa8.66□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 DGAT1O75907 488 aa8.66□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.66□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.66□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.66□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ADH1AP07327 375 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 LTKP29376 864 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 DPYDQ12882 1025 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 PKDCCQ504Y2 493 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 CCDC102BQ68D86 513 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 SIX5Q8N196 739 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 STK32AQ8WU08 396 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.65□□□□□ -1.02
GDE1-204ENST00000569773 UNC13BO14795 1591 aa8.65□□□□□ -1.03
GDE1-204ENST00000569773 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms