RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567383.5

UBE2I-216, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 I, humanhuman

TSL 4

Gene UBE2I, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2I-216ENST00000567383 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 NECTIN2Q92692 538 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 NUP98P52948 1817 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 HOXB7P09629 217 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 SETDB2Q96T68 719 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 IL16Q14005 1332 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2I-216ENST00000567383 CCER2I3L3R5 266 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 CHRNA5P30532 468 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 CHD4Q14839 1912 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 GRIN3BO60391 1043 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 WDR63Q8IWG1 891 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 TSPYL6Q8N831 410 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 COPS6Q7L5N1 327 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 ATP10DQ9P241 1426 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 CNBD1Q8NA66 436 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 PIM2Q9P1W9 311 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 YY1P25490 414 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 BCS1LQ9Y276 419 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBE2I-216ENST00000567383 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.33■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 ZNF521Q96K83 1311 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 FAM177BA6PVY3 158 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 GPTP24298 496 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 MIER1Q8N108 512 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 HYPKQ9NX55 129 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 H0YIN7 160 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 PDE6BP35913 854 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 ST5P78524 1137 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 SUSD4Q5VX71 490 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2I-216ENST00000567383 ABCC12Q96J65 1359 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 NTSR2O95665 410 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 SRGNP10124 158 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 TCIRG1Q13488 830 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 NPHP1O15259 732 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 ERFEQ4G0M1 354 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 NYXQ9GZU5 481 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 PARP10Q53GL7 1025 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 NLRP10Q86W26 655 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 TTLL6Q8N841 843 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 VAMP4O75379 141 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 GOLGA2Q08379 1002 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 STYK1Q6J9G0 422 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 SLX4Q8IY92 1834 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2I-216ENST00000567383 MASTLQ96GX5 879 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms