RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.73■■□□□ 1.39
COMMD4-218ENST00000567377 BCORQ6W2J9 1755 aa23.73■■□□□ 1.39
COMMD4-218ENST00000567377 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
COMMD4-218ENST00000567377 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.72■■□□□ 1.39
COMMD4-218ENST00000567377 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
COMMD4-218ENST00000567377 ATP10DQ9P241 1426 aa23.72■■□□□ 1.39
COMMD4-218ENST00000567377 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
COMMD4-218ENST00000567377 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.7■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 ANP32CO43423 234 aa23.7■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 CFAP44Q96MT7 982 aa23.69■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 HOXB7P09629 217 aa23.68■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 MYL6BP14649 208 aa23.68■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 APAF1O14727 1248 aa23.67■■□□□ 1.38
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COMMD4-218ENST00000567377 CNKSR1Q969H4 720 aa23.67■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 NYXQ9GZU5 481 aa23.67■■□□□ 1.38
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COMMD4-218ENST00000567377 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.66■■□□□ 1.38
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COMMD4-218ENST00000567377 STYK1Q6J9G0 422 aa23.66■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
COMMD4-218ENST00000567377 MASTLQ96GX5 879 aa23.65■■□□□ 1.38
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COMMD4-218ENST00000567377 SRGNP10124 158 aa23.64■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 C1QTNF8P60827 252 aa23.64■■□□□ 1.37
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COMMD4-218ENST00000567377 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.64■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 GNAI1P63096 354 aa23.63■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.63■■□□□ 1.37
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COMMD4-218ENST00000567377 IFT57Q9NWB7 429 aa23.63■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.62■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 SOGA3Q5TF21 947 aa23.62■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.62■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
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COMMD4-218ENST00000567377 NPR1P16066 1061 aa23.61■■□□□ 1.37
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COMMD4-218ENST00000567377 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.61■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.61■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 PARP10Q53GL7 1025 aa23.6■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 RNF181Q9P0P0 153 aa23.6■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 NUP98P52948 1817 aa23.59■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 LMNB1P20700 586 aa23.59■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.59■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.59■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.59■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 MRS2Q9HD23 443 aa23.59■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC27Q2M243 656 aa23.58■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.58■■□□□ 1.37
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
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COMMD4-218ENST00000567377 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
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COMMD4-218ENST00000567377 COPS6Q7L5N1 327 aa23.57■■□□□ 1.36
COMMD4-218ENST00000567377 PROSER3Q2NL68 480 aa23.56■■□□□ 1.36
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COMMD4-218ENST00000567377 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.56■■□□□ 1.36
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COMMD4-218ENST00000567377 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.55■■□□□ 1.36
COMMD4-218ENST00000567377 NECTIN2Q92692 538 aa23.55■■□□□ 1.36
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COMMD4-218ENST00000567377 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.55■■□□□ 1.36
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COMMD4-218ENST00000567377 GPTP24298 496 aa23.54■■□□□ 1.36
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COMMD4-218ENST00000567377 SUSD4Q5VX71 490 aa23.53■■□□□ 1.36
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COMMD4-218ENST00000567377 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.51■■□□□ 1.35
COMMD4-218ENST00000567377 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.51■■□□□ 1.35
COMMD4-218ENST00000567377 KIF3CO14782 793 aa23.5■■□□□ 1.35
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC93Q567U6 631 aa23.5■■□□□ 1.35
COMMD4-218ENST00000567377 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.5■■□□□ 1.35
COMMD4-218ENST00000567377 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.5■■□□□ 1.35
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
COMMD4-218ENST00000567377 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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