RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.77■■□□□ 1.56
PKD1-232ENST00000566905 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.77■■□□□ 1.56
PKD1-232ENST00000566905 PDIA6Q15084 440 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 HLFQ16534 295 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 PROSER3Q2NL68 480 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 NPHP1O15259 732 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 GRIN3BO60391 1043 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 HOXB7P09629 217 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 CHRNA5P30532 468 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 YY1P25490 414 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 CNBD1Q8NA66 436 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 BCS1LQ9Y276 419 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-232ENST00000566905 FAM177BA6PVY3 158 aa24.7■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 RGL2O15211 777 aa24.7■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 KCNA3P22001 575 aa24.7■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.7■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.69■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 PIM2Q9P1W9 311 aa24.69■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 IL16Q14005 1332 aa24.68■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 ST5P78524 1137 aa24.68■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 COPS6Q7L5N1 327 aa24.68■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.68■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.68■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 CCER2I3L3R5 266 aa24.67■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 GPTP24298 496 aa24.67■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.67■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 WDR63Q8IWG1 891 aa24.66■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.66■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.66■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 H0YIN7 160 aa24.65■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 ATP10DQ9P241 1426 aa24.65■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 PDE6BP35913 854 aa24.64■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.64■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 TSPYL6Q8N831 410 aa24.64■■□□□ 1.54
PKD1-232ENST00000566905 CACNA1SQ13698 1873 aa24.64■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.62■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 HYPKQ9NX55 129 aa24.62■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.61■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.61■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.6■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 NYXQ9GZU5 481 aa24.6■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 SUSD4Q5VX71 490 aa24.59■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.59■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.59■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.59■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.59■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.58■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 MIER1Q8N108 512 aa24.58■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 TTLL6Q8N841 843 aa24.58■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.58■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PKD1-232ENST00000566905 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 GOLGA2Q08379 1002 aa24.57■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 ERFEQ4G0M1 354 aa24.57■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 PARP10Q53GL7 1025 aa24.57■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.57■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.57■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 ABCC12Q96J65 1359 aa24.56■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.56■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 TCIRG1Q13488 830 aa24.55■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.55■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 NTSR2O95665 410 aa24.54■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 SRGNP10124 158 aa24.54■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 MASTLQ96GX5 879 aa24.54■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 STK31Q9BXU1 1019 aa24.54■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 SLX4Q8IY92 1834 aa24.54■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.53■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 ZNF428Q96B54 188 aa24.53■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PKD1-232ENST00000566905 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms