RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561983.5

RHOT2-204, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 5

Gene RHOT2, Length 1,044 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-204	ENST00000561983	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RHOT2-204	ENST00000561983	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73	4e-12	■□□□□ 10.5
RHOT2-204	ENST00000561983	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RHOT2-204	ENST00000561983	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.09	■■■□□ 2.73
RHOT2-204	ENST00000561983	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RHOT2-204	ENST00000561983	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RHOT2-204	ENST00000561983	MYL6B	P14649	208 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RHOT2-204	ENST00000561983	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RHOT2-204	ENST00000561983	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	HLF	Q16534	295 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	RNF181	Q9P0P0	153 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.01	■■■□□ 2.72
RHOT2-204	ENST00000561983	CNKSR1	Q969H4	720 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	CHL1	O00533	1208 aa		32	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	MASTL	Q96GX5	879 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	SRGN	P10124	158 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	C21orf2	O43822	256 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	RASSF7	Q02833	373 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	NYX	Q9GZU5	481 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	LMNB1	P20700	586 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RHOT2-204	ENST00000561983	APAF1	O14727	1248 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	NECTIN2	Q92692	538 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	NPR1	P16066	1061 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	KIF3C	O14782	793 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	PDIA6	Q15084	440 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	SBF1	O95248	1867 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	NUP98	P52948	1817 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	GPT	P24298	496 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	SOGA3	Q5TF21	947 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	ANXA1	P04083	346 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
RHOT2-204	ENST00000561983	NFKBIE	O00221	500 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	KRT24	Q2M2I5	525 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	PROSER3	Q2NL68	480 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	ANP32C	O43423	234 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	COPS6	Q7L5N1	327 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	31.87	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	ALDH1B1	P30837	517 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	HOXB7	P09629	217 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	ERFE	Q4G0M1	354 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	SUSD4	Q5VX71	490 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	SLX4	Q8IY92	1834 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	TOMM70	O94826	608 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	GNAI1	P63096	354 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	PRELP	P51888	382 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.69
RHOT2-204	ENST00000561983	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	RRAGC	Q9HB90	399 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	CACNA1S	Q13698	1873 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	CCDC93	Q567U6	631 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	GLTPD2	A6NH11	291 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	NTSR2	O95665	410 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RHOT2-204	ENST00000561983	HSPA6	P17066	643 aa		31.78	■■■□□ 2.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms