RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	6.25	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	TXK	P42681	527 aa		6.25	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.25	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.25	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		6.25	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		6.25	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK2AP1	O14519	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	COBL	O75128	1261 aa		6.24	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	MTFR1	Q15390	333 aa		6.24	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		6.24	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	TP53INP1	Q96A56	240 aa		6.24	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		6.24	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		6.24	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	ADH7	P40394	386 aa		6.23	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		6.23	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0A0MRY4	1105 aa		6.22	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957		A6NJY4	79 aa		6.21	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	RAC1	P63000	192 aa		6.21	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		6.21	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		6.21	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRB5	O75023	590 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	NEUROD1	Q13562	356 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	BANK1	Q8NDB2	785 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC30A3	Q99726	388 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	CABP1	Q9NZU7	370 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	USP3	Q9Y6I4	520 aa		6.2	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	APBB1	O00213	710 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		6.19	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	TXLNA	P40222	546 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	SPEM2	Q0P670	501 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		6.18	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	EML1	O00423	815 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	6.17	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	ILDR2	Q71H61	639 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		6.17	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC51A	Q86UW1	340 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	USP21	Q9UK80	565 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		6.16	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNQ4	P56696	695 aa		6.15	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		6.15	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAN	Q96GW7	911 aa		6.15	□□□□□ -1.42
AKAP13-223	ENST00000560957	TEAD4	Q15561	434 aa		6.14	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		6.14	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	IRAK1	P51617	712 aa		6.13	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		6.13	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		6.13	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	BACH1	O14867	736 aa		6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	CD97	P48960	835 aa		6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	FZD5	Q13467	585 aa		6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		6.12	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	NOS3	P29474	1203 aa		6.11	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	NOS2	P35228	1153 aa		6.11	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	BRD7	Q9NPI1	651 aa		6.11	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	EFCC1	Q9HA90	598 aa		6.1	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		6.1	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		6.1	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHA4	P54764	986 aa		6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO11	Q86XK2	927 aa		6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRK	Q9NRH2	765 aa		6.09	□□□□□ -1.43
AKAP13-223	ENST00000560957	FST	P19883	344 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	SSTR4	P31391	388 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	TYRO3	Q06418	890 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	BHMT	Q93088	406 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP63	Q96MT8	703 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	NAGPA	Q9UK23	515 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF114	Q9Y508	228 aa		6.08	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	IRF5	Q13568	498 aa		6.07	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		6.07	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		6.07	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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