RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	KLK14	Q9P0G3	267 aa		7.64	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		7.64	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	F11	P03951	625 aa		7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	ATP4A	P20648	1035 aa		7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	RTN1	Q16799	776 aa		7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7.62	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	MYO19	Q96H55	970 aa		7.62	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	SMARCA4	P51532	1647 aa		7.62	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PNR3	127 aa		7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF10B	O14763	440 aa		7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		7.61	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934		H3BRB1	525 aa		7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	ICMT	O60725	284 aa		7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	IFT43	Q96FT9	208 aa		7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	SUSD3	Q96L08	255 aa		7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	BCS1L	Q9Y276	419 aa		7.6	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB39	O15060	712 aa		7.59	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	MPST	P25325	297 aa		7.59	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	DBN1	Q16643	649 aa		7.59	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF787	Q6DD87	383 aa		7.59	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	STIM2	Q9P246	746 aa		7.59	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		7.59	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		7.59	□□□□□ -1.19
LINS1-210	ENST00000560934	PPFIA3	O75145	1194 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	THBS1	P07996	1170 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	WIZ	O95785	1651 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	VEGFB	P49765	207 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ECM1	Q16610	540 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	MICAL2	O94851	1124 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ITGA6	P23229	1130 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	AAMP	Q13685	434 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	EFHC2	Q5JST6	749 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ATCAY	Q86WG3	371 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	TREML1	Q86YW5	311 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	NCAPD3	P42695	1498 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	CDC14C	A4D256	554 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934		H7C1W4	665 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	FAM13A	O94988	1023 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	NPR3	P17342	541 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	NLRP8	Q86W28	1048 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ABTB2	Q8N961	1025 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	CEP63	Q96MT8	703 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	USP20	Q9Y2K6	914 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	OPLAH	O14841	1288 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ZAP70	P43403	619 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	IDH3A	P50213	366 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	HIF1A	Q16665	826 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	SMARCA2	P51531	1590 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LINS1-210	ENST00000560934	GPR25	O00155	361 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	GPR152	Q8TDT2	470 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	TYRO3	Q06418	890 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21

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