RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557249.1

PTPN21-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 21, human

TSL 2

Gene PTPN21, Length 576 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN21-209	ENST00000557249	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	LILRB5	O75023	590 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	ALB	P02768	609 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	TXLNA	P40222	546 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	ADH7	P40394	386 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	RAC1	P63000	192 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	LRP8	Q14114	963 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	EML3	Q32P44	896 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTPN21-209	ENST00000557249	NOS2	P35228	1153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SOX11	P35716	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	ABL2	P42684	1182 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	ELN	P15502	786 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	IRF5	Q13568	498 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	TEAD4	Q15561	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	USP21	Q9UK80	565 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SKI	P12755	728 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	NID1	P14543	1247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	GTF2I	P78347	998 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	MDFI	Q99750	246 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	EML1	O00423	815 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	BHMT	Q93088	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	ZNF358	Q9NW07	568 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SFI1	A8K8P3	1242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SELP	P16109	830 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	KCNQ4	P56696	695 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	HIF1A	Q16665	826 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPN21-209	ENST00000557249	PIK3CD	O00329	1044 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN21-209	ENST00000557249	NCOA4	Q13772	614 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN21-209	ENST00000557249	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN21-209	ENST00000557249	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN21-209	ENST00000557249	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN21-209	ENST00000557249	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN21-209	ENST00000557249	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN21-209	ENST00000557249	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN21-209	ENST00000557249	TYRO3	Q06418	890 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms