RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-240ENST00000556339 FAM157BP0CG42 384 aa6.79□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 MTFR1Q15390 333 aa6.79□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 FAM182BQ5T319 152 aa6.79□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.79□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 ZIC5Q96T25 663 aa6.79□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 MARK1Q9P0L2 795 aa6.79□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.79□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 RAD21O60216 631 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 ALAS2P22557 587 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 NCOA4Q13772 614 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 USP3Q9Y6I4 520 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-240ENST00000556339 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 TXLNAP40222 546 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ZNF358Q9NW07 568 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 COG6Q9Y2V7 657 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 USP17L5A8MUK1 530 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 NEUROD1Q13562 356 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 LAMC2Q13753 1193 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 TBCELQ5QJ74 424 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 CD163Q86VB7 1156 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 TRIM50Q86XT4 487 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ARHGEF11O15085 1522 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 CHD1O14646 1710 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 NOS2P35228 1153 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 CHRNA4P43681 627 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 XP32Q5T750 250 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SYT9Q86SS6 491 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 PLVAPQ9BX97 442 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 KLF15Q9UIH9 416 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SERTM1A2A2V5 107 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ATP1A2P50993 1020 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 TNS4Q8IZW8 715 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ELOA3Q8NG57 546 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ALG2Q9H553 416 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 STRN4Q9NRL3 753 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 EFSO43281 561 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 DOC2BQ14184 412 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 TEAD4Q15561 434 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 CUX1P39880 1505 aa6.71□□□□□ -1.33
ATXN3-240ENST00000556339 APBA3O96018 575 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 GATA4P43694 442 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 TRIM11Q96F44 468 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 HCN2Q9UL51 889 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 GRIN2BQ13224 1484 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 CCDC102BQ68D86 513 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 POM121Q96HA1 1249 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 CEP63Q96MT8 703 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 USP17L3A6NCW0 530 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 USP17L4A6NCW7 530 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 M0R082 166 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 EML1O00423 815 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SIN3BO75182 1162 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SPEM2Q0P670 501 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 Q8N3U1 123 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms