RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 PDE6BP35913 854 aa24.09■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.09■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.08■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 TTLL6Q8N841 843 aa24.08■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 RGL2O15211 777 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 HLFQ16534 295 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 ERBB4Q15303 1308 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 FAM177BA6PVY3 158 aa24.05■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 APAF1O14727 1248 aa24.05■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.05■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.05■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 CHL1O00533 1208 aa24.04■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.03■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 ANP32CO43423 234 aa24.03■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.03■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 NECTIN2Q92692 538 aa24.03■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.03■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC184Q52MB2 194 aa24.02■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.02■■□□□ 1.44
NEDD1-208ENST00000555806 C1QTNF8P60827 252 aa24.01■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 KRT24Q2M2I5 525 aa24.01■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 NUP98P52948 1817 aa24■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 ANXA1P04083 346 aa24■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 RNF181Q9P0P0 153 aa24■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 RASSF7Q02833 373 aa23.99■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 PDIA6Q15084 440 aa23.99■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 CFAP44Q96MT7 982 aa23.99■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 SRGNP10124 158 aa23.98■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 GPTP24298 496 aa23.98■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 PROSER3Q2NL68 480 aa23.98■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 STYK1Q6J9G0 422 aa23.98■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 CACNA1SQ13698 1873 aa23.97■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 CNKSR1Q969H4 720 aa23.97■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 MASTLQ96GX5 879 aa23.97■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 NYXQ9GZU5 481 aa23.97■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 MRS2Q9HD23 443 aa23.97■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.96■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 MBIPQ9NS73 344 aa23.96■■□□□ 1.43
NEDD1-208ENST00000555806 C21orf2O43822 256 aa23.95■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 SBF1O95248 1867 aa23.95■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.94■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.94■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.94■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 IFT57Q9NWB7 429 aa23.94■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 HOXB7P09629 217 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 NPR1P16066 1061 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 LMNB1P20700 586 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 GNAI1P63096 354 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 COPS6Q7L5N1 327 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.93■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 ABCC12Q96J65 1359 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 SLX4Q8IY92 1834 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 NFKBIEO00221 500 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF853P0CG23 659 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.91■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 ERFEQ4G0M1 354 aa23.91■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 SUSD4Q5VX71 490 aa23.91■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 PARP10Q53GL7 1025 aa23.9■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.9■■□□□ 1.42
NEDD1-208ENST00000555806 SOGA3Q5TF21 947 aa23.89■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 KIF3CO14782 793 aa23.88■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 NTSR2O95665 410 aa23.88■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 PRELPP51888 382 aa23.88■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.88■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.88■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.87■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.87■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.87■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.87■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.87■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.87■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.85■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 ALDH1B1P30837 517 aa23.85■■□□□ 1.41
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC93Q567U6 631 aa23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms