RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.72■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 CFAP44Q96MT7 982 aa21.72■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 MYL6BP14649 208 aa21.71■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.71■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 MRS2Q9HD23 443 aa21.71■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 ADCY9O60503 1353 aa21.71■■□□□ 1.07
PKP3-209ENST00000533069 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.7■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 NGEFQ8N5V2 710 aa21.7■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.7■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 HOXB7P09629 217 aa21.69■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 HLFQ16534 295 aa21.68■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 TTLL6Q8N841 843 aa21.68■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 IFT57Q9NWB7 429 aa21.68■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 ATP10DQ9P241 1426 aa21.68■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 GNAI1P63096 354 aa21.67■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 PDIA6Q15084 440 aa21.67■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.67■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.67■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 ZNF853P0CG23 659 aa21.66■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.66■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 MBIPQ9NS73 344 aa21.66■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.66■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.66■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.65■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.65■■□□□ 1.06
PKP3-209ENST00000533069 CCDC27Q2M243 656 aa21.64■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 KRT24Q2M2I5 525 aa21.64■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 NYXQ9GZU5 481 aa21.64■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 PROSER3Q2NL68 480 aa21.63■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.63■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 STYK1Q6J9G0 422 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 NECTIN2Q92692 538 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 SRGNP10124 158 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 CNKSR1Q969H4 720 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 MASTLQ96GX5 879 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 FAM177BA6PVY3 158 aa21.6■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 ANXA1P04083 346 aa21.6■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.6■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 PARP10Q53GL7 1025 aa21.59■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 COPS6Q7L5N1 327 aa21.59■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.59■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.59■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.58■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.58■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 NPR1P16066 1061 aa21.58■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 GPTP24298 496 aa21.58■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.58■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.58■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.58■■□□□ 1.05
PKP3-209ENST00000533069 WWC1Q8IX03 1113 aa21.57■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 CCER2I3L3R5 266 aa21.56■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 SOGA3Q5TF21 947 aa21.56■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.56■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 HYPKQ9NX55 129 aa21.56■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 IL16Q14005 1332 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 SUSD4Q5VX71 490 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 RNF181Q9P0P0 153 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 ABCC12Q96J65 1359 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 NUP98P52948 1817 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 C21orf2O43822 256 aa21.54■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 NTSR2O95665 410 aa21.54■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 LMNB1P20700 586 aa21.54■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 RASSF7Q02833 373 aa21.54■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 ERFEQ4G0M1 354 aa21.54■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.54■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 CRY2Q49AN0 593 aa21.53■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.53■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 NFKBIEO00221 500 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 ALDH1B1P30837 517 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 C1QTNF8P60827 252 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 TCIRG1Q13488 830 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 MIER1Q8N108 512 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.51■■□□□ 1.03
PKP3-209ENST00000533069 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PKP3-209ENST00000533069 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.51■■□□□ 1.03
PKP3-209ENST00000533069 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms