RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.95■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 MBIPQ9NS73 344 aa29.95■■■□□ 2.39
ME3-210ENST00000532471 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.95■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 SCN7AQ01118 1682 aa29.95■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 HOXB7P09629 217 aa29.94■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 ZNF853P0CG23 659 aa29.94■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 PRR5LQ6MZQ0 368 aa29.94■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.94■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 NECTIN2Q92692 538 aa29.94■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 HLFQ16534 295 aa29.93■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 CCDC27Q2M243 656 aa29.93■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.93■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 KRT24Q2M2I5 525 aa29.92■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.92■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 PDIA6Q15084 440 aa29.91■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.9■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.9■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.9■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.9■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.9■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.9■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.89■■■□□ 2.38
ME3-210ENST00000532471 WWC1Q8IX03 1113 aa29.88■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 TTLL6Q8N841 843 aa29.88■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 NYXQ9GZU5 481 aa29.88■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa29.88■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 BCORQ6W2J9 1755 aa29.87■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 FAM177BA6PVY3 158 aa29.87■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 COPS6Q7L5N1 327 aa29.87■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.86■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 ANXA1P04083 346 aa29.86■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 PROSER3Q2NL68 480 aa29.86■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.85■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.84■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.83■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 HYPKQ9NX55 129 aa29.83■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
ME3-210ENST00000532471 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.82■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 IL16Q14005 1332 aa29.81■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 GPTP24298 496 aa29.81■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 ATP10DQ9P241 1426 aa29.8■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 PARP10Q53GL7 1025 aa29.8■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.8■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.8■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 CNKSR1Q969H4 720 aa29.8■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 MASTLQ96GX5 879 aa29.8■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 SRGNP10124 158 aa29.79■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 STYK1Q6J9G0 422 aa29.79■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 WDR63Q8IWG1 891 aa29.79■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.78■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.77■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.77■■■□□ 2.36
ME3-210ENST00000532471 SUSD4Q5VX71 490 aa29.76■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 NUP98P52948 1817 aa29.75■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 NPR1P16066 1061 aa29.75■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.75■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.74■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 TCIRG1Q13488 830 aa29.74■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.74■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.73■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 ERFEQ4G0M1 354 aa29.73■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 ALDH1B1P30837 517 aa29.72■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa29.72■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 C21orf2O43822 256 aa29.7■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 SOGA3Q5TF21 947 aa29.7■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.7■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 TSPYL6Q8N831 410 aa29.7■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
ME3-210ENST00000532471 NTSR2O95665 410 aa29.69■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 GOLGA2Q08379 1002 aa29.69■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.69■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 STK31Q9BXU1 1019 aa29.69■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.68■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 NLRP10Q86W26 655 aa29.68■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 NLRP3Q96P20 1036 aa29.68■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.68■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 CCER2I3L3R5 266 aa29.67■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 RNF181Q9P0P0 153 aa29.67■■■□□ 2.34
ME3-210ENST00000532471 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms