RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.63■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ANXA1P04083 346 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.62■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 SERPINB2P05120 415 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 HLFQ16534 295 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPYL6Q8N831 410 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 SETDB2Q96T68 719 aa24.58■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP10DQ9P241 1426 aa24.58■■□□□ 1.53
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 CHD4Q14839 1912 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 TGFB2P61812 414 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 COPS6Q7L5N1 327 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA2Q08379 1002 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 HYPKQ9NX55 129 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.52■■□□□ 1.52
PACSIN3-208ENST00000531226 CACNA1SQ13698 1873 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 CNBD1Q8NA66 436 aa24.51■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0G2JLW4 131 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 DPEP1P16444 411 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR162Q16538 588 aa24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 E9PSI1 815 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 NPHP1O15259 732 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 VAMP4O75379 141 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 STK31Q9BXU1 1019 aa24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 GPTP24298 496 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 ST5P78524 1137 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.47■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNA3P22001 575 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 SLFN5Q08AF3 891 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.46■■□□□ 1.51
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM177BA6PVY3 158 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 CHRNA5P30532 468 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 PARP10Q53GL7 1025 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 NYXQ9GZU5 481 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 TCIRG1Q13488 830 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 LAMB2P55268 1798 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE6BP35913 854 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 SUSD4Q5VX71 490 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 PIM2Q9P1W9 311 aa24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 GRIN3BO60391 1043 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 NTSR2O95665 410 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC4A2P04920 1241 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCC12Q96J65 1359 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 H0YIN7 160 aa24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 BCS1LQ9Y276 419 aa24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-208ENST00000531226 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3-208ENST00000531226 NLRP10Q86W26 655 aa24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3-208ENST00000531226 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms