RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CLVS1-209ENST00000522928 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.52□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 H7C1W4 665 aa7.51□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.51□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 FAM26DQ5JW98 314 aa7.51□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 NLRP8Q86W28 1048 aa7.51□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 C2CD2LO14523 706 aa7.5□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 FOXO3O43524 673 aa7.5□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.5□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.5□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 STRN4Q9NRL3 753 aa7.5□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 EFSO43281 561 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 SSFA2P28290 1259 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 TNP2Q05952 138 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 KCNMA1Q12791 1236 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 GRIN2CQ14957 1233 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 RETREG2Q8NC44 543 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 SUSD3Q96L08 255 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.49□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 SLURP2P0DP57 97 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 ATP2B4P23634 1241 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 CTBSQ01459 385 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 COX20Q5RI15 118 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 MYO19Q96H55 970 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 NGLY1Q96IV0 654 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 TNFRSF10BO14763 440 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 RTN1Q16799 776 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 EFHC2Q5JST6 749 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 PGBD3Q8N328 593 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 WHAMMQ8TF30 809 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 KLK14Q9P0G3 267 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 SEPT3Q9UH03 358 aa7.47□□□□□ -1.21
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.46□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 FAM157BP0CG42 384 aa7.46□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 COL26A1Q96A83 441 aa7.46□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.45□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.45□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 KLF15Q9UIH9 416 aa7.45□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.44□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 TYRO3Q06418 890 aa7.44□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 USTQ9Y2C2 406 aa7.44□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 OPLAHO14841 1288 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 ADAMTS2O95450 1211 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 CD33P20138 364 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 FGFR3P22607 806 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 DGKZQ13574 1117 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 MBIPQ9NS73 344 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 IGF1RP08069 1367 aa7.43□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB39O15060 712 aa7.42□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 INPP5BP32019 993 aa7.42□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 KCNQ4P56696 695 aa7.42□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 IER5Q5VY09 327 aa7.42□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 ACDQ96AP0 544 aa7.42□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.42□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 MX2P20592 715 aa7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 FAM182BQ5T319 152 aa7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 C16orf46Q6P387 395 aa7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.41□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 IFT43Q96FT9 208 aa7.4□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 SLC30A3Q99726 388 aa7.4□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 MDFIQ99750 246 aa7.4□□□□□ -1.22
CLVS1-209ENST00000522928 MICAL2O94851 1124 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGEF15O94989 841 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 ECM1Q16610 540 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CLVS1-209ENST00000522928 LAMC2Q13753 1193 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms