RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 CPLX1O14810 134 aa6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 CCP110O43303 1012 aa6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 PLCG2P16885 1265 aa6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 PNMA2Q9UL42 364 aa6.96□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 GRM8O00222 908 aa6.95□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.95□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 NWD1Q149M9 1564 aa6.95□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 MAP3K12Q12852 859 aa6.95□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.95□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.95□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 CFAP45Q9UL16 551 aa6.95□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MST1RQ04912 1400 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MAST3O60307 1309 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 CTAGE5O15320 804 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 ZPR1O75312 459 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 SEMA3EO15041 775 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 TPM1P09493 284 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 DDB1Q16531 1140 aa6.94□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MCTP2Q6DN12 878 aa6.94□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 PLIN1O60240 522 aa6.93□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.93□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 CALM2P0DP24 149 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 CALM3P0DP25 149 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MRE11P49959 708 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MYOM1P52179 1685 aa6.92□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 ST5P78524 1137 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 ZNF790Q6PG37 636 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MTA3Q9BTC8 594 aa6.92□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 MCM10Q7L590 875 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 AACSQ86V21 672 aa6.92□□□□□ -1.3
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POLK-215ENST00000514141 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.92□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 AKAP12Q02952 1782 aa6.91□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.91□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
POLK-215ENST00000514141 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.91□□□□□ -1.3
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