RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 NPHP1O15259 732 aa31.23■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 BCS1LQ9Y276 419 aa31.23■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 KCNA3P22001 575 aa31.22■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 CHRNA5P30532 468 aa31.22■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.22■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM9BQ8IZU0 186 aa31.22■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa31.22■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 HLFQ16534 295 aa31.21■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCDC27Q2M243 656 aa31.21■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 PIM2Q9P1W9 311 aa31.21■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.21■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.2■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa31.2■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 ERVV-1B6SEH8 477 aa31.2■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 PDIA6Q15084 440 aa31.2■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.2■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 CNBD1Q8NA66 436 aa31.2■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANXA1P04083 346 aa31.19■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 HOXB7P09629 217 aa31.19■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 PROSER3Q2NL68 480 aa31.18■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 ST5P78524 1137 aa31.17■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa31.17■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.17■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 WWC1Q8IX03 1113 aa31.17■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCDC24Q8N4L8 307 aa31.17■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZBTB3Q9H5J0 574 aa31.17■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.16■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 C2CD5Q86YS7 1000 aa31.15■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 BRIP1Q9BX63 1249 aa31.15■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP31.15■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 H0YIN7 160 aa31.14■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
RASGEF1B-210ENST00000512716 PDE6BP35913 854 aa31.13■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 CHPF2Q9P2E5 772 aa31.13■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM177BA6PVY3 158 aa31.12■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATP10DQ9P241 1426 aa31.12■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.11■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa31.11■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 COPS6Q7L5N1 327 aa31.1■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 XAGE3Q8WTP9 111 aa31.1■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 GPTP24298 496 aa31.09■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa31.09■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 IL16Q14005 1332 aa31.08■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa31.08■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
RASGEF1B-210ENST00000512716 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 C8orf58Q8NAV2 365 aa31.07■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 NYXQ9GZU5 481 aa31.07■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 CACNA1SQ13698 1873 aa31.07■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 TTLL6Q8N841 843 aa31.06■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP31.06■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF34Q8IZ26 560 aa31.05■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 UBN2Q6ZU65 1347 aa31.04■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 HYPKQ9NX55 129 aa31.04■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 WDR63Q8IWG1 891 aa31.03■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa31.02■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 PARP10Q53GL7 1025 aa31.01■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 SUSD4Q5VX71 490 aa31.01■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 NUTM1Q86Y26 1132 aa31.01■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 TSPYL6Q8N831 410 aa31.01■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 CHMP4AQ9BY43 222 aa31.01■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa31■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 SRGNP10124 158 aa31■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.99■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 STYK1Q6J9G0 422 aa30.99■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.99■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 MASTLQ96GX5 879 aa30.99■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCC12Q96J65 1359 aa30.98■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 ERFEQ4G0M1 354 aa30.98■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa30.98■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.98■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 CNKSR1Q969H4 720 aa30.98■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.98■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLX4Q8IY92 1834 aa30.97■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCER2I3L3R5 266 aa30.97■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 SBF1O95248 1867 aa30.96■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 NTSR2O95665 410 aa30.96■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 TCIRG1Q13488 830 aa30.96■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADCY9O60503 1353 aa30.95■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 NPR1P16066 1061 aa30.95■■■□□ 2.55
RASGEF1B-210ENST00000512716 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 GOLGA2Q08379 1002 aa30.93■■■□□ 2.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 RIC1Q4ADV7 1423 aa30.92■■■□□ 2.54
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms