RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 NECTIN2Q92692 538 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 MBIPQ9NS73 344 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMB2P55268 1798 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 HLFQ16534 295 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 BCS1LQ9Y276 419 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIN3BO60391 1043 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 PDIA6Q15084 440 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SLX4Q8IY92 1834 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF853P0CG23 659 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP44Q96MT7 982 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ERBB4Q15303 1308 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP10DQ9P241 1426 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 SETDB2Q96T68 719 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CNBD1Q8NA66 436 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 IFT57Q9NWB7 429 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 ADCY9O60503 1353 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC12Q96J65 1359 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM177BA6PVY3 158 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PIM2Q9P1W9 311 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 RGL2O15211 777 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 GNAI1P63096 354 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 GPTP24298 496 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 WWC1Q8IX03 1113 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 NPHP1O15259 732 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXB7P09629 217 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 ST5P78524 1137 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC27Q2M243 656 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-218ENST00000511185 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF1P21675 1872 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 H0YIN7 160 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 COPS6Q7L5N1 327 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE6BP35913 854 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPYL6Q8N831 410 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA1FO60840 1977 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RASSF7Q02833 373 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SUSD4Q5VX71 490 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.484e-7■■□□□ 11.4
SH3BP2-218ENST00000511185 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-218ENST00000511185 NTSR2O95665 410 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SRGNP10124 158 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ERFEQ4G0M1 354 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL6Q8N841 843 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF428Q96B54 188 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PRELPP51888 382 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 IL16Q14005 1332 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 COL4A1P02462 1669 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 NYXQ9GZU5 481 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 STYK1Q6J9G0 422 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MASTLQ96GX5 879 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-218ENST00000511185 NFKBIEO00221 500 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-218ENST00000511185 C21orf2O43822 256 aa24.2■■□□□ 1.46
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