RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 NFKBIEO00221 500 aa16.75■□□□□ 0.27
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SH3BP2-216ENST00000510193 CACNA1SQ13698 1873 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP2-216ENST00000510193 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-216ENST00000510193 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-216ENST00000510193 SLX4Q8IY92 1834 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP2-216ENST00000510193 STYK1Q6J9G0 422 aa16.71■□□□□ 0.27
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SH3BP2-216ENST00000510193 KRT24Q2M2I5 525 aa16.69■□□□□ 0.26
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SH3BP2-216ENST00000510193 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.68■□□□□ 0.26
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SH3BP2-216ENST00000510193 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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SH3BP2-216ENST00000510193 APAF1O14727 1248 aa16.61■□□□□ 0.25
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SH3BP2-216ENST00000510193 CFAP44Q96MT7 982 aa16.61■□□□□ 0.25
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SH3BP2-216ENST00000510193 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC93Q567U6 631 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 SOGA3Q5TF21 947 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 COPS6Q7L5N1 327 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP2-216ENST00000510193 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP2-216ENST00000510193 COL4A5P29400 1685 aa16.59■□□□□ 0.25
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