RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RUNDC1Q96C34 613 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF181Q9P0P0 153 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGL2O15211 777 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYL6BP14649 208 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLFQ16534 295 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM177BA6PVY3 158 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RASSF7Q02833 373 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SBF1O95248 1867 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF3CO14782 793 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C21orf2O43822 256 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRGNP10124 158 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STYK1Q6J9G0 422 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNKSR1Q969H4 720 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERBB4Q15303 1308 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMNB1P20700 586 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MASTLQ96GX5 879 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM35Q9UPQ4 493 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.52■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NMRK2Q9NPI5 230 aa30.52■■■□□ 2.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUP98P52948 1817 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM2BQ8NHM5 1336 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CACNA1SQ13698 1873 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFKBIEO00221 500 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHL1O00533 1208 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NECTIN2Q92692 538 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NYXQ9GZU5 481 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLX4Q8IY92 1834 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPR1P16066 1061 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRELPP51888 382 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPTP24298 496 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANXA1P04083 346 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDIA6Q15084 440 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOMM70O94826 608 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUTM1Q86Y26 1132 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT24Q2M2I5 525 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PROSER3Q2NL68 480 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOGA3Q5TF21 947 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRAGCQ9HB90 399 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APAF1O14727 1248 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPA6P17066 643 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERFEQ4G0M1 354 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUSD4Q5VX71 490 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COPS6Q7L5N1 327 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFAP44Q96MT7 982 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLTPD2A6NH11 291 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALDH1B1P30837 517 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LTBP3Q9NS15 1303 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC12Q96J65 1359 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC93Q567U6 631 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XAGE3Q8WTP9 111 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.37■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARP10Q53GL7 1025 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPY19L2Q6NUT2 758 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NTSR2O95665 410 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC184Q52MB2 194 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MBIPQ9NS73 344 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXB7P09629 217 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRY2Q49AN0 593 aa30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms