RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.24■□□□□ 0.35
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PGGT1B-204ENST00000503638 ANXA1P04083 346 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC30Q5VVM6 783 aa17.23■□□□□ 0.35
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PGGT1B-204ENST00000503638 NBPF15Q8N660 670 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1B-204ENST00000503638 STK31Q9BXU1 1019 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1B-204ENST00000503638 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa17.23■□□□□ 0.35
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PGGT1B-204ENST00000503638 ERBB4Q15303 1308 aa17.21■□□□□ 0.35
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PGGT1B-204ENST00000503638 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
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PGGT1B-204ENST00000503638 USPL1Q5W0Q7 1092 aa17.2■□□□□ 0.34
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PGGT1B-204ENST00000503638 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.2■□□□□ 0.34
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PGGT1B-204ENST00000503638 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
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PGGT1B-204ENST00000503638 NARFQ9UHQ1 456 aa17.18■□□□□ 0.34
PGGT1B-204ENST00000503638 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.18■□□□□ 0.34
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PGGT1B-204ENST00000503638 BICDL1Q6ZP65 573 aa17.17■□□□□ 0.34
PGGT1B-204ENST00000503638 ZBTB3Q9H5J0 574 aa17.17■□□□□ 0.34
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PGGT1B-204ENST00000503638 PDIA6Q15084 440 aa17.16■□□□□ 0.34
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PGGT1B-204ENST00000503638 COPS6Q7L5N1 327 aa17.16■□□□□ 0.34
PGGT1B-204ENST00000503638 GYS1P13807 737 aa17.15■□□□□ 0.34
PGGT1B-204ENST00000503638 FKBP8Q14318 412 aa17.15■□□□□ 0.34
PGGT1B-204ENST00000503638 NLGN1Q8N2Q7 840 aa17.15■□□□□ 0.34
PGGT1B-204ENST00000503638 NPHP1O15259 732 aa17.14■□□□□ 0.33
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PGGT1B-204ENST00000503638 CEP350Q5VT06 3117 aa17.13■□□□□ 0.33
PGGT1B-204ENST00000503638 CAMTA2O94983 1202 aa17.13■□□□□ 0.33
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PGGT1B-204ENST00000503638 MMP10P09238 476 aa17.13■□□□□ 0.33
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PGGT1B-204ENST00000503638 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa17.13■□□□□ 0.33
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PGGT1B-204ENST00000503638 PARP3Q9Y6F1 533 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1B-204ENST00000503638 SCN7AQ01118 1682 aa17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-204ENST00000503638 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
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PGGT1B-204ENST00000503638 BCL2L12Q9HB09 334 aa17.1■□□□□ 0.33
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PGGT1B-204ENST00000503638 G2E3Q7L622 706 aa17.09■□□□□ 0.33
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PGGT1B-204ENST00000503638 SSH1Q8WYL5 1049 aa17.09■□□□□ 0.33
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF428Q96B54 188 aa17.09■□□□□ 0.33
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PGGT1B-204ENST00000503638 PI4KAP2A4QPH2 592 aa17.06■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 DDR1Q08345 913 aa17.06■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
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PGGT1B-204ENST00000503638 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.06■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 MYD88Q99836 296 aa17.06■□□□□ 0.32
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PGGT1B-204ENST00000503638 RARSP54136 660 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 NEXNQ0ZGT2 675 aa17.05■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 KSR2Q6VAB6 950 aa17.05■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 RGL2O15211 777 aa17.04■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 TM4SF1P30408 202 aa17.04■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC4A10Q6U841 1118 aa17.04■□□□□ 0.32
PGGT1B-204ENST00000503638 CNBD1Q8NA66 436 aa17.04■□□□□ 0.32
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