RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 HLFQ16534 295 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 MYL6BP14649 208 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 ST5P78524 1137 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 FAM177BA6PVY3 158 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 RASSF7Q02833 373 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 RNF181Q9P0P0 153 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 ERBB4Q15303 1308 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 CHL1O00533 1208 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 APAF1O14727 1248 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 PDIA6Q15084 440 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 KRT24Q2M2I5 525 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC184Q52MB2 194 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 ANXA1P04083 346 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 SRGNP10124 158 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 PROSER3Q2NL68 480 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 NECTIN2Q92692 538 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 STYK1Q6J9G0 422 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 NFKBIEO00221 500 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 KIF3CO14782 793 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 C21orf2O43822 256 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 GPTP24298 496 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 PRELPP51888 382 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 MASTLQ96GX5 879 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 CNKSR1Q969H4 720 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 CFAP44Q96MT7 982 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRU-207ENST00000492954 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 LMNB1P20700 586 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 NYXQ9GZU5 481 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 ABCC12Q96J65 1359 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 NPR1P16066 1061 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 NUP98P52948 1817 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 SBF1O95248 1867 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 SUSD4Q5VX71 490 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 MBIPQ9NS73 344 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 ERFEQ4G0M1 354 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 COPS6Q7L5N1 327 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 SLX4Q8IY92 1834 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF853P0CG23 659 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 ANP32CO43423 234 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 NTSR2O95665 410 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 HOXB7P09629 217 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-207ENST00000492954 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 IFT57Q9NWB7 429 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 SOGA3Q5TF21 947 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 CACNA1SQ13698 1873 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 GNAI1P63096 354 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 CRY2Q49AN0 593 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 PARP10Q53GL7 1025 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 MRS2Q9HD23 443 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 CEP350Q5VT06 3117 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC93Q567U6 631 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 OLFM4Q6UX06 510 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 RRAGCQ9HB90 399 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 TOMM70O94826 608 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-207ENST00000492954 ALDH1B1P30837 517 aa23.4■■□□□ 1.34
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