RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554		H0YIN7	160 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDE6B	P35913	854 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	NPHP1	O15259	732 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	ST5	P78524	1137 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTLL6	Q8N841	843 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	CHL1	O00533	1208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	MYL6B	P14649	208 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SCAMP4-208	ENST00000489554	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	HLF	Q16534	295 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	HOXB7	P09629	217 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDIA6	Q15084	440 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	STYK1	Q6J9G0	422 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	CNKSR1	Q969H4	720 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	SRGN	P10124	158 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	GNAI1	P63096	354 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	IL16	Q14005	1332 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	NPR1	P16066	1061 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	LMNB1	P20700	586 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPT	P24298	496 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	RASSF7	Q02833	373 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	NFKBIE	O00221	500 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	C21orf2	O43822	256 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	ANXA1	P04083	346 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	NUP98	P52948	1817 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SCAMP4-208	ENST00000489554	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.62	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms