RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486010.1

MAGED4B-208, Transcript of MAGE family member D4B, humanhuman

TSL 3

Gene MAGED4B, Length 889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4B-208ENST00000486010 LMNB1P20700 586 aa22.37■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 NFE2L2Q16236 605 aa22.37■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 ST5P78524 1137 aa22.35■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 NGEFQ8N5V2 710 aa22.35■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 NUP98P52948 1817 aa22.35■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 FAM177BA6PVY3 158 aa22.34■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 HLFQ16534 295 aa22.34■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.34■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.34■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.33■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.33■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.33■■□□□ 1.17
MAGED4B-208ENST00000486010 SRGNP10124 158 aa22.32■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 RALBP1Q15311 655 aa22.3■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 STYK1Q6J9G0 422 aa22.3■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 CNKSR1Q969H4 720 aa22.3■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 MASTLQ96GX5 879 aa22.3■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 GLTPD2A6NH11 291 aa22.29■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 APLP1P51693 650 aa22.29■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.29■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 WDR90Q96KV7 1748 aa22.28■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 MYL6BP14649 208 aa22.28■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 RIPK4P57078 832 aa22.28■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.28■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 HTRA3P83110 453 aa22.27■■□□□ 1.16
MAGED4B-208ENST00000486010 ERFEQ4G0M1 354 aa22.26■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 OLFM4Q6UX06 510 aa22.25■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.25■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.25■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.25■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.25■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 RGL2O15211 777 aa22.24■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 NPR1P16066 1061 aa22.24■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 FSTL1Q12841 308 aa22.24■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.24■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 POTECB2RU33 542 aa22.23■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 NEUROD2Q15784 382 aa22.23■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.23■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.23■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.23■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.22■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 GPTP24298 496 aa22.22■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.22■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.22■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.21■■□□□ 1.15
MAGED4B-208ENST00000486010 ANXA1P04083 346 aa22.2■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.2■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 ABCC12Q96J65 1359 aa22.2■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 PROSER3Q2NL68 480 aa22.19■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 SOGA3Q5TF21 947 aa22.19■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.19■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 PDIA6Q15084 440 aa22.18■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 CCDC93Q567U6 631 aa22.18■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 SUSD4Q5VX71 490 aa22.18■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 NECTIN2Q92692 538 aa22.18■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.17■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.17■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 NYXQ9GZU5 481 aa22.17■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 KRT24Q2M2I5 525 aa22.16■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 ERBB4Q15303 1308 aa22.15■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 ALDH1B1P30837 517 aa22.15■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.15■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.15■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.15■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MAGED4B-208ENST00000486010 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 CRY2Q49AN0 593 aa22.14■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 RUNDC1Q96C34 613 aa22.14■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.14■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.13■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 NTSR2O95665 410 aa22.13■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.13■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 SLC51AQ86UW1 340 aa22.13■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 POTEIP0CG38 1075 aa22.12■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 POTEJP0CG39 1038 aa22.12■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.12■■□□□ 1.13
MAGED4B-208ENST00000486010 SYNE4Q8N205 404 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms