RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484571.5

VWA3B-215, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 3

Gene VWA3B, Length 717 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-215ENST00000484571 NPHP1O15259 732 aa26.96■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 C1QTNF8P60827 252 aa26.95■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.95■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.95■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 NEUROD2Q15784 382 aa26.94■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.93■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 STYK1Q6J9G0 422 aa26.92■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.91■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 HOXB7P09629 217 aa26.9■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 CNKSR1Q969H4 720 aa26.9■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 NYXQ9GZU5 481 aa26.9■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 SRGNP10124 158 aa26.89■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 MYL6BP14649 208 aa26.89■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 HLFQ16534 295 aa26.89■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.89■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 MASTLQ96GX5 879 aa26.89■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 CFAP44Q96MT7 982 aa26.89■■□□□ 1.9
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 PDIA6Q15084 440 aa26.87■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 SOGA3Q5TF21 947 aa26.87■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.87■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.86■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 NGEFQ8N5V2 710 aa26.86■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 APAF1O14727 1248 aa26.85■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.85■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 RNF181Q9P0P0 153 aa26.85■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.84■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 NPR1P16066 1061 aa26.84■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 LMNB1P20700 586 aa26.84■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 PARP10Q53GL7 1025 aa26.83■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 IFT57Q9NWB7 429 aa26.83■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
VWA3B-215ENST00000484571 ANP32CO43423 234 aa26.82■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF853P0CG23 659 aa26.82■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.82■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.82■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 GNAI1P63096 354 aa26.81■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.81■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.81■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.8■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 NUP98P52948 1817 aa26.79■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 NFKBIEO00221 500 aa26.79■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 KIF3CO14782 793 aa26.79■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.79■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.79■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.79■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.79■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 C21orf2O43822 256 aa26.78■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 ALDH1B1P30837 517 aa26.78■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 RASSF7Q02833 373 aa26.78■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 PROSER3Q2NL68 480 aa26.78■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 CRY2Q49AN0 593 aa26.78■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.78■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 MBIPQ9NS73 344 aa26.78■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 SBF1O95248 1867 aa26.77■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.77■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC27Q2M243 656 aa26.77■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
VWA3B-215ENST00000484571 FAM177BA6PVY3 158 aa26.76■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 COPS6Q7L5N1 327 aa26.76■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 GPTP24298 496 aa26.75■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 KRT24Q2M2I5 525 aa26.75■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 SUSD4Q5VX71 490 aa26.75■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.75■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.75■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 NTSR2O95665 410 aa26.74■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC184Q52MB2 194 aa26.74■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.74■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.74■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 ABCC12Q96J65 1359 aa26.73■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 ANXA1P04083 346 aa26.73■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 ERFEQ4G0M1 354 aa26.73■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC93Q567U6 631 aa26.73■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 MRS2Q9HD23 443 aa26.73■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 HYPKQ9NX55 129 aa26.73■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.73■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.72■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 TOMM70O94826 608 aa26.72■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.72■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 NECTIN2Q92692 538 aa26.72■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.72■■□□□ 1.87
VWA3B-215ENST00000484571 PRELPP51888 382 aa26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms