RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L10C9JJH3 530 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L12C9JPN9 530 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L11C9JVI0 530 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L21D6R901 530 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L18D6R9N7 530 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L22D6RA61 530 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-211ENST00000484135 USP17L19D6RCP7 530 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRC-211ENST00000484135 C2CD2LO14523 706 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRC-211ENST00000484135 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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PTPRC-211ENST00000484135 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-211ENST00000484135 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-211ENST00000484135 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRC-211ENST00000484135 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-211ENST00000484135 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRC-211ENST00000484135 FAM182BQ5T319 152 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRC-211ENST00000484135 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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PTPRC-211ENST00000484135 HCN2Q9UL51 889 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 IGFBP4P22692 258 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 HIF1AQ16665 826 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 SUSD3Q96L08 255 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 BRD7Q9NPI1 651 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 EPXP11678 715 aa8.35□□□□□ -1.07
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