RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXB7P09629 217 aa25.02■■□□□ 1.6
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SH3BP4-209ENST00000484097 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-209ENST00000484097 HLFQ16534 295 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP4-209ENST00000484097 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP4-209ENST00000484097 PIM2Q9P1W9 311 aa25■■□□□ 1.59
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SH3BP4-209ENST00000484097 BCS1LQ9Y276 419 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP4-209ENST00000484097 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25■■□□□ 1.59
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SH3BP4-209ENST00000484097 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
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SH3BP4-209ENST00000484097 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.98■■□□□ 1.59
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SH3BP4-209ENST00000484097 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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SH3BP4-209ENST00000484097 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP98P52948 1817 aa24.97■■□□□ 1.59
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SH3BP4-209ENST00000484097 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.96■■□□□ 1.59
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SH3BP4-209ENST00000484097 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.95■■□□□ 1.58
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SH3BP4-209ENST00000484097 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.95■■□□□ 1.58
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SH3BP4-209ENST00000484097 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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SH3BP4-209ENST00000484097 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.85■■□□□ 1.57
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SH3BP4-209ENST00000484097 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.84■■□□□ 1.57
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SH3BP4-209ENST00000484097 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.83■■□□□ 1.57
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SH3BP4-209ENST00000484097 NLRP10Q86W26 655 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-209ENST00000484097 MIER1Q8N108 512 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-209ENST00000484097 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-209ENST00000484097 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-209ENST00000484097 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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