RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 H0YIN7 160 aa30.18■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 RGL2O15211 777 aa30.18■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 CHL1O00533 1208 aa30.17■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.17■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 PDE6BP35913 854 aa30.15■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 KRT24Q2M2I5 525 aa30.15■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 TTLL6Q8N841 843 aa30.15■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 ERBB4Q15303 1308 aa30.15■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 APAF1O14727 1248 aa30.14■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 PDIA6Q15084 440 aa30.14■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.14■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.14■■■□□ 2.42
PSME4-208ENST00000481518 NPHP1O15259 732 aa30.13■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 ST5P78524 1137 aa30.13■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.12■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.12■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 NUP98P52948 1817 aa30.11■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 C1QTNF8P60827 252 aa30.11■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 PROSER3Q2NL68 480 aa30.11■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.11■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.418e-14■■□□□ 13.6
PSME4-208ENST00000481518 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.11■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 FAM177BA6PVY3 158 aa30.1■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 ANXA1P04083 346 aa30.1■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.1■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 RASSF7Q02833 373 aa30.09■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 NECTIN2Q92692 538 aa30.09■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 SRGNP10124 158 aa30.08■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 SBF1O95248 1867 aa30.08■■■□□ 2.41
PSME4-208ENST00000481518 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.07■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 CFAP44Q96MT7 982 aa30.06■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 RNF181Q9P0P0 153 aa30.06■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.05■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 GPTP24298 496 aa30.05■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 PRELPP51888 382 aa30.05■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 STYK1Q6J9G0 422 aa30.05■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 CACNA1SQ13698 1873 aa30.04■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 MBIPQ9NS73 344 aa30.04■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 ABCC12Q96J65 1359 aa30.03■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 SLX4Q8IY92 1834 aa30.03■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.03■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 NFKBIEO00221 500 aa30.03■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 ZNF853P0CG23 659 aa30.03■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 C21orf2O43822 256 aa30.02■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 MASTLQ96GX5 879 aa30.02■■■□□ 2.4
PSME4-208ENST00000481518 ANP32CO43423 234 aa30.01■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 NUTM1Q86Y26 1132 aa30.01■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.01■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 CNKSR1Q969H4 720 aa30.01■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 CHPF2Q9P2E5 772 aa30■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 KIF3CO14782 793 aa29.99■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 SUSD4Q5VX71 490 aa29.99■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 COPS6Q7L5N1 327 aa29.99■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.99■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 MRS2Q9HD23 443 aa29.99■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 IFT57Q9NWB7 429 aa29.99■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.98■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 HOXB7P09629 217 aa29.98■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 NPR1P16066 1061 aa29.98■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 ERFEQ4G0M1 354 aa29.98■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.98■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 NYXQ9GZU5 481 aa29.98■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 LMNB1P20700 586 aa29.97■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.97■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 NTSR2O95665 410 aa29.96■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.96■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 GNAI1P63096 354 aa29.95■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
PSME4-208ENST00000481518 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.95■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.95■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.94■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.94■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.94■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 CRY2Q49AN0 593 aa29.93■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 PARP10Q53GL7 1025 aa29.91■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.91■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 OLFM4Q6UX06 510 aa29.89■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.89■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.89■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.89■■■□□ 2.38
PSME4-208ENST00000481518 CCDC27Q2M243 656 aa29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1129 ms