RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 C21orf2O43822 256 aa20.11■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 SRGNP10124 158 aa20.11■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 APLP1P51693 650 aa20.11■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 HLFQ16534 295 aa20.11■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 NUP98P52948 1817 aa20.11■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.1■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 CNBD1Q8NA66 436 aa20.1■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.1■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 GLTPD2A6NH11 291 aa20.09■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 PDE6BP35913 854 aa20.09■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 SETDB2Q96T68 719 aa20.09■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 ABCC12Q96J65 1359 aa20.08■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.08■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 SLC51AQ86UW1 340 aa20.08■□□□□ 0.81
TNS1-216ENST00000480665 STYK1Q6J9G0 422 aa20.07■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.07■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 FSTL1Q12841 308 aa20.06■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 OLFM4Q6UX06 510 aa20.06■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 COL4A5P29400 1685 aa20.06■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 NFE2L2Q16236 605 aa20.05■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.05■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 RGL2O15211 777 aa20.04■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.04■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.04■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 IFFO2Q5TF58 517 aa20.03■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.02■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 ST5P78524 1137 aa20.02■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 MASTLQ96GX5 879 aa20.02■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
TNS1-216ENST00000480665 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.01■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 POTEIP0CG38 1075 aa20.01■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 POTEJP0CG39 1038 aa20.01■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 KLRG1Q96E93 195 aa20.01■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.01■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 PDIA6Q15084 440 aa20■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 JMYQ8N9B5 988 aa20■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 CNKSR1Q969H4 720 aa20■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 FAM177BA6PVY3 158 aa19.99■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 ERFEQ4G0M1 354 aa19.99■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.99■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 RIC1Q4ADV7 1423 aa19.99■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa19.99■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 NPR1P16066 1061 aa19.98■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 CRY2Q49AN0 593 aa19.98■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.98■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.98■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.98■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 LTBP1Q14766 1721 aa19.97■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 DDNO94850 711 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.97■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 NGEFQ8N5V2 710 aa19.97■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 LAMB2P55268 1798 aa19.97■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 ZNF541Q9H0D2 1346 aa19.97■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 ERVV-1B6SEH8 477 aa19.96■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 PROSER3Q2NL68 480 aa19.96■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TNS1-216ENST00000480665 SCN4AP35499 1836 aa19.95■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 MYL6BP14649 208 aa19.95■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 NTSR2O95665 410 aa19.94■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 CCDC93Q567U6 631 aa19.94■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 SUSD4Q5VX71 490 aa19.94■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.94■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.94■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.94■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 NPHP1O15259 732 aa19.93■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 ANXA1P04083 346 aa19.93■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 GPTP24298 496 aa19.93■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 COL4A1P02462 1669 aa19.93■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 KRT24Q2M2I5 525 aa19.92■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 SOGA3Q5TF21 947 aa19.91■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 ERBB4Q15303 1308 aa19.91■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.91■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 RIPK4P57078 832 aa19.9■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 RALBP1Q15311 655 aa19.9■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.9■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.9■□□□□ 0.78
TNS1-216ENST00000480665 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 DPY19L2Q6NUT2 758 aa19.89■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 PASKQ96RG2 1323 aa19.88■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.88■□□□□ 0.77
TNS1-216ENST00000480665 TAF1P21675 1872 aa19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms